Package: pizzly (0.37.3+ds-9) [debports]

Links for pizzly

Debian Resources:

Bug Reports

Download Source Package :

Not found

Maintainers:

External Resources:

Homepage [github.com]

Similar packages:

Identificerer genfusioner i RNA-sekventeringsdata

Til fortolkningen af transkriptomet (overfloden og sekvens af RNA) af kræftceller er man især interesseret i transskriptioner, der ikke kan kortlægges til enkeltstående gener, men som ses at være fusioneret som dele fra to gener. Sandsynlige forklaringer er kromosomale translokationer.

Pizzly kan identificere nye sådanne særheder ved at bygge videre på fortolkninger af variabel splejsning med værktøjet kallisto. Begge værktøjer er elementer i bcbio-arbejdsgangen.

Other Packages Related to pizzly

depends

recommends

suggests

enhances

dep: kallisto

Næsten optimal RNA-Seq-kvantificering
dep: libc6 (>= 2.36)

GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.4)

GCC støttebibliotek
dep: libstdc++6 (>= 12.2.0-9)

GNU Standard C++ bibliotek v3
dep: python3

Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Komprimeringsbibliotek - kørselstid

rec: python3-h5py

Almene Pythongrænseflader til hdf5

Download pizzly

Download for all available architectures
Architecture	Package Size	Installed Size	Files
sh4 (unofficial port)	334.6 kB	864.0 kB	[list of files]