Paketti: pizzly (0.37.3+ds-9) [debports]

Links for pizzly

Debian-palvelut:

Vikailmoitukset

Imuroi lähdekoodipaketti :

Ei löytynyt

Ylläpitäjät:

External Resources:

Kotisivu [github.com]

Samankaltaisia paketteja:

Identifies gene fusions in RNA sequencing data

For the interpretation of the transcriptome (the abundance and sequence of RNA) of tomour cells one is particularly interested in transcripts that cannot be mapped to single genes but that are seen to be fused as parts from two genes. Likely eplanations are chromosomal translocations.

Pizzly can identify novel such peculiarities, building on interpretations on variable splicing by the tool kallisto. Both tools are elements of the bcbio workflow.

Muut pakettiin pizzly liittyvät paketit

depends

recommends

suggests

enhances

dep: kallisto

near-optimal RNA-Seq quantification
dep: libc6 (>= 2.36)

GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.4)

GCC:n apukirjasto
dep: libstdc++6 (>= 12.2.0-9)

GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

rec: python3-h5py

general-purpose Python interface to hdf5

Imuroi pizzly

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille
Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
sh4 (epävirallinen siirros)	334.6 kt	864.0 kt	[tiedostoluettelo]