[ Source: bioperl-run ]
Package: bioperl-run (1.7.3-11)
Links for bioperl-run
Debian Resources:
Download Source Package bioperl-run:
Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
- Charles Plessy (QA Page)
- Andreas Tille (QA Page)
- Étienne Mollier (QA Page)
External Resources:
- Homepage [metacpan.org]
Similar packages:
BioPerl-omslag: skripter
Indeholder skripter fra pakken BioPerl-Run. Denne pakke vil også installere alle programmer pakket i Debian som kan have omslag. Dem som ikke er frie »foreslås« af denne pakke.
Other Packages Related to bioperl-run
|
|
|
|
-
- dep: bioperl (>= 1.7.4)
- Perlværktøjer til modellering af molekylær biologi
-
- dep: default-jdk-headless
- Standardjava eller Javakompatibel udviklingssæt - teksthovedløs
-
- dep: libbio-cluster-perl
- BioPerl-klyngemoduler
-
- dep: libbio-eutilities-perl
- BioPerl-grænseflade til Entrez Programming Utilities - E-utilities
-
- dep: libbio-featureio-perl
- Moduler til at læse, skrive og manipulere sekvensfunktioner
-
- dep: libbio-perl-run-perl (= 1.7.3-11)
- BioPerl-omslag - moduler
-
- dep: libbio-tools-run-remoteblast-perl
- Objekt for ekstern afvikling af NCBI Blast via HTTP
-
- dep: libsoap-lite-perl
- Perlimplementering af en SOAP-klient og -server
-
- dep: libtest-requiresinternet-perl
- module to easily test network connectivity
-
- dep: perl
- Larry Walls praktiske uddragnings- og rapportsprog (Perl)
-
- rec: amap-align
- Proteinflerjustering af sekvensudglødning
-
- rec: bwa
- Burrows-Wheeler Aligner (sekvenssammenligner)
-
- rec: exonerate
- generisk værktøj til parvis sekvenssammenligning
-
- rec: kalign
- Global og progressiv flersekvensjustering
-
- rec: lagan
- Parameteropsat parvist og globalt sammenligningsprogram for genomsekvenser
-
- rec: mafft
- Program til justering af flere aminosyrer eller nukleotide sekvenser
-
- rec: maq
- kortlægger korte, fast-længde, polymorfiske DNA-sekvenslæsninger til reference-sekvenser
-
- rec: muscle
- Flerjusteringsprogram for proteinsekvenser
-
- rec: ncbi-blast+-legacy
- NCBI Blast-forældet kaldskript
-
- rec: ncoils
- Coiled coil - sekundær strukturforudsigelse
-
- rec: pal2nal
- Konverterer proteiner til genomisk DNA-sammenligning
-
- rec: phylip
- Programpakke for udledning af fylogenier
-
- rec: primer3
- Værktøj til at designe flankerende, oligo-nukleotider til DNA-amplifikation
-
- rec: probalign
- Multiple sekvensjustering med brug partitionsfunktionel posteriore sandsynligheder
-
- rec: probcons
- Flersekvens-sammenstilling baseret på probabilistisk konsistens (PROBabilistic CONSistency)
-
- rec: raxml
- Randomized Axelerated Maximum Likelihood for pylogenetiske træer
-
- rec: sim4
- Værktøj for justering af cDNA og genomisk DNA
-
- rec: t-coffee
- Flersekvensjustering
-
- rec: wise
- Sammenligning af bioplymerer, såsom DNA- og protein-sekvenser
-
- sug: bedtools
- Programpakke med redskaber for sammenligning af arvemassefunktioner
-
- sug: bowtie
- Ultrahurtig og hukommelseseffektiv short read-sammenligner
-
- sug: clustalw
- Global nukleotid eller peptid sekvensjustering
-
- sug: emboss
- Programpakke til europæisk molekylærbiologi
-
- sug: fasta3
- Værktøjer til at søge i samlinger med biologiske sekvenser
-
- sug: gmap
- Opdelt og SNP-overholdende justering for mRNA og korte læsninger
-
- sug: hmmer
- Profilskjulte Markov-modeller for proteinsekvensanalyse
-
- sug: infernal
- Logisk slutning for RNA-sekundære struktursammenligninger
-
- sug: libbio-tools-run-alignment-clustalw-perl
- Bioperl-grænseflade til Clustal W
-
- sug: pftools
- Byg og søg protein- og DNA-generaliserede profiler
-
- sug: phyml
- Fylogenisk estimering der bruger maksimum lIkelihood
-
- sug: samtools
- Forarbejdning af sekvensopstillinger i SAM-, BAM- og CRAM-formater
-
- sug: tigr-glimmer
- Gen-detektion i arkæer og bakterier
-
- sug: trnascan-se
- detection of transfer RNA genes in genomic sequence
Download bioperl-run
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| all | 35.3 kB | 89.0 kB | [list of files] |