Package: maq (0.7.1-10)

Links for maq

Debian Resources:

Download Source Package maq:

Maintainers:

Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
Andreas Tille (QA Page)
Charles Plessy (QA Page)
Étienne Mollier (QA Page)

External Resources:

Homepage [maq.sourceforge.net]

Similar packages:

kortlægger korte, fast-længde, polymorfiske DNA-sekvenslæsninger til reference-sekvenser

Maq (forkortelse af »Mapping and Assembly with Quality«) bygger kortlagte montager fra korte læsninger genereret af næste generation inden for maskiner til sekvensering. Det blev særligt designet til »Illumina-Solexa 1G Genetic Analyzer«, og har indledende funktionalitet til at håndtere ABI SOLid-data. Maq var tidligere kendt som mapass2.

Udvikling af Maq stoppede i 2008. Dets efterfølger er BWA og SAMtools.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c++, implemented-in::perl, User Interface: Command Line, Role: role::program, scope::utility, Purpose: Need an extra tag, Analysing, use::comparing, use::searching, Supports Format: Need an extra tag, works-with-format::plaintext, works-with::TODO

Other Packages Related to maq

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libc6 (>= 2.38)

GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 4.2)

GCC støttebibliotek
dep: libstdc++6 (>= 5)

GNU Standard C++ bibliotek v3
dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

Komprimeringsbibliotek - kørselstid

sug: bwa

Burrows-Wheeler Aligner (sekvenssammenligner)
sug: samtools

Forarbejdning af sekvensopstillinger i SAM-, BAM- og CRAM-formater

Download maq

Download for all available architectures
Architecture	Package Size	Installed Size	Files
ppc64el	303.5 kB	645.0 kB	[list of files]