Package: libvcflib1 (1.0.9+dfsg-1 and others) [debports]

Links for libvcflib1

Debian Resources:

Bug Reports

Download Source Package :

Not found

Maintainers:

External Resources:

Homepage [github.com]

Similar packages:

C++-bibliotek til at fortolke og manipulere VCF-filer

Variant Call Format (VCF) er en flad fil, indryk afgrænser tekstformatet, lavet til præcist at beskrive referenceindekserede variationer mellem individer. VCF tilbyder et fælles udvekslingsformat for beskrivelsen af variation i individer og befolkninger, og har nogle standardformater til rapportering for en bred vifte af registreringsprogrammer til genvarianter.

Vcflib tilbyder metoder til at manipulere og fortolke sekvensvariation som det er beskrevet af VCF. Det er både:

 * en API til at fortolke og arbejde på poster med genvariation, som
   det kan beskrives af VCF-formatet
 * og en samling af kommandolinjeredskaber for afvikling af komplekse
   manipuleringer på VCF-filer.

Other Packages Related to libvcflib1

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libc6 (>= 2.29) [not ia64, riscv64, sh4]

GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.33) [riscv64]

dep: libc6 (>= 2.35) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.35) [ia64]

GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6.1-udeb
dep: libdisorder0 (>= 0.0.2)

Bibliotek for entropimåling af bytestrømme
dep: libfastahack0 (>= 0.0+git20160702.bbc645f) [ia64, sparc64]

Bibliotek for indeksering og sekvensudtrækning fra FASTA-filer - bibliotek

dep: libfastahack0 (>= 1.0.0+dfsg) [not ia64, sparc64]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ppc64, x32]

GCC støttebibliotek

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64, sh4, sparc64]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

GCC støttebibliotek
dep: libgomp1 (>= 4.2.1) [sparc64]

GCC OpenMP-understøttelsesbibliotek (GOMP)
dep: libsmithwaterman0 (>= 0.0+git20160702.2610e25)

Bestem lignende regioner mellem to strenge eller genomsekvenser - bibliotek
dep: libssw0 (>= 1.1) [sparc64]

fast SIMD parallelized implementation of the Smith-Waterman algorithm
dep: libstdc++6 (>= 11)

GNU Standard C++ bibliotek v3
dep: libtabixpp0 (>= 1.0.0)

C++ wrapper to tabix indexer
dep: libunwind8 [ia64]

Bibliotek til at bestemme call-chain for et program - kørselstid
dep: libwfa2-0 (>= 2.3.2) [riscv64]

exact gap-affine algorithm (shared library)

Download libvcflib1

Download for all available architectures
Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
ia64 (unofficial port)	1.0.3+dfsg-2	181.3 kB	833.0 kB	[list of files]
m68k (unofficial port)	1.0.3+dfsg-2	137.1 kB	405.0 kB	[list of files]
ppc64 (unofficial port)	1.0.3+dfsg-2	153.0 kB	533.0 kB	[list of files]
riscv64 (unofficial port)	1.0.9+dfsg-1	167.7 kB	377.0 kB	[list of files]
sh4 (unofficial port)	1.0.3+dfsg-2	167.4 kB	406.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	1.0.3+dfsg-2	123.4 kB	1,057.0 kB	[list of files]
x32 (unofficial port)	1.0.3+dfsg-2	149.7 kB	397.0 kB	[list of files]