Package: python-cogent (1.9-14)

Links for python-cogent

Debian Resources:

Download Source Package python-cogent:

Maintainers:

External Resources:

Homepage [pycogent.org]

Similar packages:

Ramme for genomisk biologi

PyCogent er et programbibliotek for genomisk biologi. Det er en fuldt integreret og gennemtestet ramme for:

 * kontrol af tredjepartsprogrammer
 * udarbejde arbejdsgange; forespørge databaser
 * gennemføre nye probabilistiske analyser af biologisk sekvensevolution og
 * oprette grafik i udgivelseskvalitet

Det har mange unikke indbyggede funktioner (som ægte codonsammenligning) og den hyppige tilføjelse af helt nye metoder til analysen af genomdata.

Tags: Biology: Proteins, Software Development: Python Development, Libraries, Field: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implemented in: implemented-in::python, interface::commandline, Role: Development Library, Program, Purpose: use::analysing, use::comparing

Other Packages Related to python-cogent

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

dep: libc6 (>= 2.4) [armhf, i386]
dep: python

Interaktivt objektorienteret sprog på højt niveau - Python 2-version

dep: python (<< 2.8)

dep: python (>= 2.7~)
dep: python-matplotlib

Pythonbaseret plotsystem i en stil der ligner Matlab
dep: python-numpy (>= 1:1.16.0~rc1)

Numerisk Python tilføjer en hurtig vektor-/array-facilitet til Pythonsproget
dep: python-numpy-abi9

virtual package provided by python-numpy

rec: blast2

Tom overgangspakke for ncbi-blast+-legacy
rec: bwa [amd64]

Burrows-Wheeler Aligner (sekvenssammenligner)
rec: cd-hit

Programpakke designet til hurtigt at gruppere sekvenser
rec: clearcut

Ekstrem effektiv fylogenetisk trærekonstruktion
rec: dialign

Segmentbaseret flersekvensjustering
rec: muscle

Flerjusteringsprogram for proteinsekvenser

sug: cdbfasta

Constant DataBase-indekserings- og indhentelsesværktøj for multi-FASTA-filer
sug: clustalw

Global nukleotid eller peptid sekvensjustering
sug: fasttree

Fylogenetiske træer fra opstillinger af nukleotid- eller proteinsekvenser
sug: infernal [amd64, i386]

Logisk slutning for RNA-sekundære struktursammenligninger
sug: mafft

Program til justering af flere aminosyrer eller nukleotide sekvenser
sug: mothur

Programpakke for sekvensanalyse til forskning i mikrobiota
sug: parsinsert

Påholdende Indsættelse af uklassificerede sekvenser i fylogenetiske træer
sug: python-cogent-doc

docs for python-cogent
sug: raxml [amd64, i386]

Randomized Axelerated Maximum Likelihood for pylogenetiske træer
sug: rdp-classifier

Udvidelig sekvensklassifikation for fungal lsu, bakterie og arkæisk 16s
sug: rtax

Klassifikation af sekvenslæsninger for 165 ribosomal RNA-gen

Download python-cogent

Download for all available architectures
Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	2,424.4 kB	7,794.0 kB	[list of files]
arm64	2,378.8 kB	7,680.0 kB	[list of files]
armhf	2,383.5 kB	7,349.0 kB	[list of files]
i386	2,394.6 kB	7,765.0 kB	[list of files]