[ Source: mmseqs2 ]
Package: mmseqs2 (12-113e3+ds-3 and others)
Links for mmseqs2
Debian Resources:
Download Source Package mmseqs2:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
Ultra hurtig og sensitiv proteinsøgning og klyngeopbygning
MMseqs2 (Many-against-Many sequence searching) er en programpakke til at søge og klyngeopbygge store protein/nukleotid-sekvenssæt. MMseqs2 er udgivet under en GPL-licens implementeret i C++ for Linux, MacOS og (som betaversion, via cygwin) Windows. Programmet er designet til afvikling på flere kerner og servere og har rigtig god skalering. MMseqs2 kan afvikle 10.000 gange hurtigere end BLAST. Med 100 gange dennes hastighed opnår den næsten den samme følsomhed. Kan udføre profilsøgninger med den samme sensitivitet som PSI-BLAST med over 400 gange dennes hastighed.
Other Packages Related to mmseqs2
|
|
|
|
-
- dep: libatomic1 (>= 4.8) [not armhf, i386, ppc64el]
- Understøttelsesbibliotek der tilbyder __atomic indbyggede funktioner
-
- dep: libbz2-1.0
- højkvalitets bloksorteringsfilpakningsbibliotek - kørselstid
-
- dep: libc6 (>= 2.29)
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64el]
- GCC støttebibliotek
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]
-
- dep: libgomp1 (>= 6)
- GCC OpenMP-understøttelsesbibliotek (GOMP)
-
- dep: libgzstream0 (>= 1.5+dfsg)
- Tilbyd funktionalitet for zlib C-bibliotek i en C++-iostrøm
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armel, armhf]
- GNU Standard C++ bibliotek v3
- dep: libstdc++6 (>= 9) [not armel, armhf]
-
- dep: libzstd1 (>= 1.4.0)
- Hurtig komprimeringsalgoritme uden kvalitetstab
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- Komprimeringsbibliotek - kørselstid
Download mmseqs2
| Architecture | Version | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|---|
| amd64 | 12-113e3+ds-3+b1 | 6,422.6 kB | 27,745.0 kB | [list of files] |
| arm64 | 12-113e3+ds-3+b1 | 4,392.2 kB | 7,557.0 kB | [list of files] |
| armel | 12-113e3+ds-3+b1 | 4,368.0 kB | 7,590.0 kB | [list of files] |
| armhf | 12-113e3+ds-3+b1 | 4,428.5 kB | 6,574.0 kB | [list of files] |
| i386 | 12-113e3+ds-3+b1 | 8,546.8 kB | 42,009.0 kB | [list of files] |
| mips64el | 12-113e3+ds-3+b1 | 4,319.5 kB | 8,242.0 kB | [list of files] |
| mipsel | 12-113e3+ds-3+b1 | 4,323.8 kB | 8,181.0 kB | [list of files] |
| ppc64el | 12-113e3+ds-3+b1 | 4,438.4 kB | 7,933.0 kB | [list of files] |