[ Zdroj: mmseqs2 ]
Balík: mmseqs2 (12-113e3+ds-3 a iné)
Odkazy pre mmseqs2
Zdroje Debian:
Stiahnuť zdrojový balík mmseqs2:
Správcovia:
Externé zdroje:
- Domovská stránka [github.com]
Podobné balíky:
ultra fast and sensitive protein search and clustering
MMseqs2 (Many-against-Many sequence searching) is a software suite to search and cluster huge proteins/nucleotide sequence sets. MMseqs2 is open source GPL-licensed software implemented in C++ for Linux, MacOS, and (as beta version, via cygwin) Windows. The software is designed to run on multiple cores and servers and exhibits very good scalability. MMseqs2 can run 10000 times faster than BLAST. At 100 times its speed it achieves almost the same sensitivity. It can perform profile searches with the same sensitivity as PSI-BLAST at over 400 times its speed.
Ostatné balíky súvisiace s balíkom mmseqs2
|
|
|
|
-
- dep: libatomic1 (>= 4.8) [nie armhf, i386, ppc64el]
- pomocná knižnica poskytujúca zabudované funkcie __atomic
-
- dep: libbz2-1.0
- kvalitná knižnica na komprimáciu súborov s triedením blokov - dynamická knižnica
-
- dep: libc6 (>= 2.29)
- knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64el]
- podporná knižnica GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]
-
- dep: libgomp1 (>= 6)
- podporná knižnica GCC OpenMP (GOMP)
-
- dep: libgzstream0 (>= 1.5+dfsg)
- provide functionality of zlib C-library in a C++ iostream
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armel, armhf]
- štandardná knižnica C++ GNU v3
- dep: libstdc++6 (>= 9) [nie armel, armhf]
-
- dep: libzstd1 (>= 1.4.0)
- rýchly bezstratový komprimačný algoritmus
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- komprimačná knižnica - dynamická verzia
Stiahnuť mmseqs2
| Architektúra | Verzia | Veľkosť balíka | Nainštalovaná veľkosť | Súbory |
|---|---|---|---|---|
| amd64 | 12-113e3+ds-3+b1 | 6,422.6 kB | 27,745.0 kB | [zoznam súborov] |
| arm64 | 12-113e3+ds-3+b1 | 4,392.2 kB | 7,557.0 kB | [zoznam súborov] |
| armel | 12-113e3+ds-3+b1 | 4,368.0 kB | 7,590.0 kB | [zoznam súborov] |
| armhf | 12-113e3+ds-3+b1 | 4,428.5 kB | 6,574.0 kB | [zoznam súborov] |
| i386 | 12-113e3+ds-3+b1 | 8,546.8 kB | 42,009.0 kB | [zoznam súborov] |
| mips64el | 12-113e3+ds-3+b1 | 4,319.5 kB | 8,242.0 kB | [zoznam súborov] |
| mipsel | 12-113e3+ds-3+b1 | 4,323.8 kB | 8,181.0 kB | [zoznam súborov] |
| ppc64el | 12-113e3+ds-3+b1 | 4,438.4 kB | 7,933.0 kB | [zoznam súborov] |