Pakiet: mmseqs2 (12-113e3+ds-3 i inne)

Odnośniki dla mmseqs2

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego mmseqs2:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [github.com]

Podobne pakiety:

ultra fast and sensitive protein search and clustering

MMseqs2 (Many-against-Many sequence searching) is a software suite to search and cluster huge proteins/nucleotide sequence sets. MMseqs2 is open source GPL-licensed software implemented in C++ for Linux, MacOS, and (as beta version, via cygwin) Windows. The software is designed to run on multiple cores and servers and exhibits very good scalability. MMseqs2 can run 10000 times faster than BLAST. At 100 times its speed it achieves almost the same sensitivity. It can perform profile searches with the same sensitivity as PSI-BLAST at over 400 times its speed.

Inne pakiety związane z mmseqs2

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libatomic1 (>= 4.8) [nie armhf, i386, ppc64el]

Biblioteka wsparcia zapewniająca wbudowane funkcje __atomic
dep: libbz2-1.0

Wysokiej jakości biblioteka kompresji plików - wersja uruchomieniowa
dep: libc6 (>= 2.29)

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64el]

Biblioteka wspomagająca GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]
dep: libgomp1 (>= 6)

Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)
dep: libgzstream0 (>= 1.5+dfsg)

provide functionality of zlib C-library in a C++ iostream
dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armel, armhf]

Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

dep: libstdc++6 (>= 9) [nie armel, armhf]
dep: libzstd1 (>= 1.4.0)

Algorytm do szybkiej bezstratnej kompresji
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

Pobieranie mmseqs2

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	12-113e3+ds-3+b1	6 422,6 KiB	27 745,0 KiB	[lista plików]
arm64	12-113e3+ds-3+b1	4 392,2 KiB	7 557,0 KiB	[lista plików]
armel	12-113e3+ds-3+b1	4 368,0 KiB	7 590,0 KiB	[lista plików]
armhf	12-113e3+ds-3+b1	4 428,5 KiB	6 574,0 KiB	[lista plików]
i386	12-113e3+ds-3+b1	8 546,8 KiB	42 009,0 KiB	[lista plików]
mips64el	12-113e3+ds-3+b1	4 319,5 KiB	8 242,0 KiB	[lista plików]
mipsel	12-113e3+ds-3+b1	4 323,8 KiB	8 181,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	12-113e3+ds-3+b1	4 438,4 KiB	7 933,0 KiB	[lista plików]