[ Source: resfinder ]
Package: resfinder (3.2-3)
Links for resfinder
Debian Resources:
Download Source Package resfinder:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [bitbucket.org]
Similar packages:
Identificer erhvervede antimikrobielle resistensgener
ResFinder identificerer erhvervede antimikrobielle resistensgener i alt eller delvise sekventerede isolater af bakterier.
ResFinder der bruger BLAST til identifikation af erhvervede antimikrobielle resistensgener i whole-genome-data. Som data kan metoden bruge både genomer samlet på forhånd, fuldstændige genomer eller delvise genomer, og korte sekvenslæsninger fra fire forskellige sekventeringsplatforme. Metoden blev evalueret på 1.862 GenBank-filer indeholdende 1.411 forskellige resistensgener, samt på 23 de-novo-sekventerede isolater.
Other Packages Related to resfinder
|
|
|
|
-
- dep: ncbi-blast+-legacy
- NCBI Blast-forældet kaldskript
-
- dep: python3
- Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3
-
- dep: python3-cgecore
- Python 3-modul for Center for Genomic Epidemiology
-
- dep: python3-distutils
- Distutils-pakke for Python 3.x
-
- dep: python3-tabulate
- Forskønnede tabulære data i Python 3
-
- dep: resfinder-db
- ResFinder-databasen er en kurateret database for erhvervede resistensgener
Download resfinder
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| all | 10.6 kB | 47.0 kB | [list of files] |