[ Paquet source : resfinder ]
Paquet : resfinder (3.2-3)
Liens pour resfinder
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source resfinder :
Responsables :
Ressources externes :
- Page d'accueil [bitbucket.org]
Paquets similaires :
identify acquired antimicrobial resistance genes
ResFinder identifies acquired antimicrobial resistance genes in total or partial sequenced isolates of bacteria.
ResFinder that uses BLAST for identification of acquired antimicrobial resistance genes in whole-genome data. As input, the method can use both pre-assembled, complete or partial genomes, and short sequence reads from four different sequencing platforms. The method was evaluated on 1862 GenBank files containing 1411 different resistance genes, as well as on 23 de-novo-sequenced isolates.
Autres paquets associés à resfinder
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- dep: ncbi-blast+-legacy
- script d’appel de legacy de BLAST du NCBI
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- dep: python3
- langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3
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- dep: python3-cgecore
- Python3 module for the Center for Genomic Epidemiology
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- dep: python3-distutils
- paquet distutils pour Python⋅3.x
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- dep: python3-tabulate
- pretty-print tabular data in Python3
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- dep: resfinder-db
- ResFinder database is a curated database of acquired resistance genes
Télécharger resfinder
| Architecture | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
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| all | 10,6 ko | 47,0 ko | [liste des fichiers] |