[ Source: r-bioc-purecn ]
Package: r-bioc-purecn (1.20.0+dfsg-3)
Links for r-bioc-purecn
Debian Resources:
Download Source Package r-bioc-purecn:
- [r-bioc-purecn_1.20.0+dfsg-3.dsc]
- [r-bioc-purecn_1.20.0+dfsg.orig.tar.xz]
- [r-bioc-purecn_1.20.0+dfsg-3.debian.tar.xz]
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [bioconductor.org]
Similar packages:
Kopier nummerkald og SNV-klassifikation via målrettet kort læsningssekventering
Denne pakke estimerer tumorrenhed, kopiantal og tab af heterozygositet (LOH), og klassificerer enkeltnukleotidvarianter (SNV'er) efter somatisk status og klonalitet. PureCN er designet til målrettede korte læsningssekventeringsdata, integrerer sig godt med somatisk variantregistrering og kopinummerdatakanalser samt har understøttelse for tumorprøver uden matchende normale prøver.
Other Packages Related to r-bioc-purecn
|
|
|
|
-
- dep: r-api-4.0
- virtual package provided by r-base-core
-
- dep: r-api-bioc-3.12
- virtual package provided by r-bioc-biocgenerics
-
- dep: r-base-core (>= 4.0.3-1)
- GNU R-kerne af statistisk beregning og grafiksystem
-
- dep: r-bioc-biocgenerics
- Generiske funktioner for Bioconductor
-
- dep: r-bioc-biostrings
- GNU R-strengobjekter der repræsenterer biologiske sekvenser
-
- dep: r-bioc-dnacopy
- R-pakke: dataanalyse af DNA-kopinummer
-
- dep: r-bioc-genomeinfodb
- BioConductor-redskaber til at manipulere kromosomidentifikatorer
-
- dep: r-bioc-genomicfeatures
- GNU R-værktøjer til at lave og manipulere transcript centric-annotationer
-
- dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.20.3)
- BioConductor-repræsentation og manipulation af genomiske intervaller
-
- dep: r-bioc-iranges (>= 2.2.1)
- GNU R - containere på lavt niveau til at lagre sæt af heltalsintervaller
-
- dep: r-bioc-rhdf5
- BioConductor HDF5 interface to R
-
- dep: r-bioc-rsamtools
- GNU R-binær sammenligning (BAM), variantkald (BCF) eller tabix-filimport
-
- dep: r-bioc-rtracklayer
- GNU R-grænseflade til genombrowsere og deres annotationsspor
-
- dep: r-bioc-s4vectors
- BioConductor S4-implementering af vektorer og lister
-
- dep: r-bioc-summarizedexperiment
- BioConductor - assay-container
-
- dep: r-bioc-variantannotation (>= 1.14.1)
- BioConductor-annotation af genetiske varianter
-
- dep: r-cran-data.table
- GNU R-udvidelse af Data.frame
-
- dep: r-cran-futile.logger
- Logredskab for GNU R
-
- dep: r-cran-ggplot2
- Implementering af Grammar of Graphics
-
- dep: r-cran-gridextra
- GNU R-pakke med udvidelser for pakken grid
-
- dep: r-cran-matrix
- GNU R-pakke til klasser for tætte matricer og matricer med få udfald
-
- dep: r-cran-rcolorbrewer
- GNU R-pakke der tilbyder egnede farvepaletter
-
- dep: r-cran-vgam
- GNU R-pakke for estimering af vektorgeneraliserede additive modeller
-
- rec: r-cran-testthat
- GNU R-testpakke
-
- sug: r-bioc-biocparallel
- BioConductor - faciliteter for parallel evulering
-
- sug: r-bioc-biocstyle
- Standardstile for vignettes og andre Biocunductor-dokumenter
-
- sug: r-bioc-org.hs.eg.db
- Genom-bred annotation for mennesker
-
- sug: r-cran-covr
- test coverage for GNU R packages
-
- sug: r-cran-jsonlite
- Robust, High Performance JSON Parser and Generator for R
-
- sug: r-cran-knitr
- GNU R-pakke for dynamisk rapportoprettelse via Literate Programming
-
- sug: r-cran-optparse
- GNU/R-fortolker for kommandolinjetilvalg
-
- sug: r-cran-pscbs
- R-pakke - analyse af overordnede og specifikke DNA-kopinumre
-
- sug: r-cran-rmarkdown
- convert R markdown documents into a variety of formats
Download r-bioc-purecn
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| all | 5,180.1 kB | 8,174.0 kB | [list of files] |