Package: gbrowse (2.56+dfsg-8)

Links for gbrowse

Debian Resources:

Download Source Package gbrowse:

Maintainers:

Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
Olivier Sallou (QA Page)
Charles Plessy (QA Page)
Aaron M. Ucko (QA Page)
Andreas Tille (QA Page)

External Resources:

Homepage [gmod.org]

Similar packages:

GMOD Generic Genome Browser

Generic Genome Browser er en simpel men netbaseret arvemassebrowser, der kan konfigureres. Det er en komponent i Generic Model Organism Systems Database-projektet (GMOD). Nogle af dens funktioner:

 * Samtidig fugleperspektiv og detaljeret visning af arvemassen
 * Rul, zoom, centrer
 * Vedhæft arbitrære adresser til enhver annotation
 * Rækkefølge og fremtoning af spor kan tilpasses af administrator
   og slutbruger
 * Søg efter annotations-id, navn eller kommentar
 * Understøtter tredjepartsannotation med GFF-formater
 * Indstillinger fungerer på tværs af sessioner
 * DNA- og GFF-dump
 * Forbindelse til andre databaser, inklusive BioSQL og Chado
 * Understøttelse af flere sprog
 * Indlæsning af funktioner fra tredjepart
 * Udvidelsesmodularkitektur der kan tilpasses (f.eks. kør BLAST, dump
   og importer mange formater, find oligonucleotider, design primere, opret
   begrænsningskort, rediger funktioner).

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::perl, interface::web, Role: Program, Purpose: Analysing, use::viewing, web::application, World Wide Web: CGI

Other Packages Related to gbrowse

depends

recommends

suggests

enhances

dep: apache2

Apache HTTP-server

or httpd-cgi

virtual package provided by apache2, lighttpd, mini-httpd, nginx-core, nginx-extras, nginx-full, nginx-light, ocsigenserver, tntnet, yaws
dep: bioperl

Perlværktøjer til modellering af molekylær biologi
dep: libbio-coordinate-perl

BioPerl-moduler til arbejdet med biologiske koordinater
dep: libbio-db-seqfeature-perl

Normalized feature for use with Bio::DB::SeqFeature::Store
dep: libbio-graphics-perl

Opret GD-aftryk af Bio::Seq-objekter
dep: libcgi-session-perl

persistent session data in CGI applications
dep: libdbd-sqlite3-perl

Perl DBI-driver med en selvindeholdt RDBMS
dep: libgd-gd2-noxpm-perl

virtual package provided by libgd-perl

or libgd-gd2-perl

virtual package provided by libgd-perl
dep: libhttp-daemon-perl

Simpel http-serverklasse
dep: libio-string-perl

Emuler IO::File-grænseflade for in-core-strenge
dep: libjs-prototype

JavaScript Framework for dynamiske internetprogrammer
dep: libjs-scriptaculous

JavaScript-bibliotek for dynamiske internetprogrammer
dep: libjson-perl

modul for manipulering af JSON-formaterede data
dep: libstatistics-descriptive-perl

Perl module for basic descriptive statistical functions
dep: libterm-readkey-perl

Perlmodul for simpel terminalkontrol
dep: libvm-ec2-perl

module providing controls on Amazon EC2 and Eucalyptus
dep: libwww-perl

Simpel og konsistent grænseflade til World Wide Web
dep: lsb-base

Linux Standardbase - initskript-funktionalitet
dep: perl

Larry Walls praktiske uddragnings- og rapportsprog (Perl)
dep: sqlite3

Kommandolinjebrugerflade for SQLite 3

rec: apache2 (>= 2.4.6-4~)

Apache HTTP-server

or httpd

virtual package provided by apache2, lighttpd, micro-httpd, mini-httpd, nginx-core, nginx-extras, nginx-full, nginx-light, ocsigenserver, tntnet, webfs, yaws

sug: gbrowse-calign

CAlign-hjælpeprogram
sug: gbrowse-data

Eksempler på data til GBrowse
sug: libfile-nfslock-perl

perl module to do NFS (or not) locking

Download gbrowse

Download for all available architectures
Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	2,318.3 kB	7,018.0 kB	[list of files]