all options
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Source: libtfbs-perl  ]

Package: libtfbs-perl (0.7.1-3 and others)

Links for libtfbs-perl

Screenshot

Debian Resources:

Download Source Package libtfbs-perl:

Maintainers:

External Resources:

Similar packages:

Skanning af en DNA-sekvens med en positionsvægtet matrix

Perlmodulet TFBS betår af et sæt af rutiner til interaktion med Transfac- og Jaspar-databaser, der beskriver en speciel proteinfamilie, transkriptionsfaktorerne. Disse binder sig til genom-DNA for at igangsætte (eller forhindre) udlæsningen af et gen. Når flere bindingssteder er kendt for en transkriptionsfaktor, så samles disse i en enkelt fil og sammenlignes for at finde for positionen specifikke karakteristika, der kan bruges til at forudse sådanne bindingshændelser i nye DNA-sekvenser.

Hvis du bruger TFBS i dit arbejde, så citer venligst »Lenhard B., Wasserman W.W. (2002) TFBS: Computational framework for transcription factor binding site analysis. Bioinformatics 18:1135-1136«.

Bemærk: Perlmodulet TFBS er ikke længere under aktiv udvikling. Al funktionalitet kan findes i pakken TFBSTools Bioconductor; brugere anbefales at skifte. <http://bioconductor.org/packages/TFBSTools/>.

Tags: Software Development: Perl Development, Libraries, Field: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implemented in: C, implemented-in::perl, interface::commandline, Role: Development Library, Program

Other Packages Related to libtfbs-perl

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Download libtfbs-perl

Download for all available architectures
Architecture Version Package Size Installed Size Files
amd64 0.7.1-3+b2 228.4 kB989.0 kB [list of files]
arm64 0.7.1-3+b2 228.4 kB989.0 kB [list of files]
armel 0.7.1-3+b2 229.5 kB989.0 kB [list of files]
armhf 0.7.1-3+b2 227.8 kB985.0 kB [list of files]
i386 0.7.1-3+b2 229.1 kB993.0 kB [list of files]
mips64el 0.7.1-3+b2 228.4 kB990.0 kB [list of files]
mipsel 0.7.1-3+b2 228.1 kB986.0 kB [list of files]
ppc64el 0.7.1-3+b2 229.3 kB1,037.0 kB [list of files]
s390x 0.7.1-3+b2 228.3 kB989.0 kB [list of files]