all options
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Source: libfastahack  ]

Package: libfastahack-dev (1.0.0+dfsg-7)

Links for libfastahack-dev

Screenshot

Debian Resources:

Download Source Package libfastahack:

Maintainers:

External Resources:

Similar packages:

Bibliotek for indeksering og sekvensudtrækning fra FASTA-filer - udvikling

Fastahack er et lille program til indeksering og udtrækning af sekvenser og undersekvenser fra FASTA-filer. Det inkluderede Fasta.cpp-bibliotek tilbyder en FASTA-læser og et indeksprogram, som kan indlejres i programmer, som vil have nytte af direkte læsning af undersekvenser fra FASTA-filer. Biblioteket håndterer automatisk oprettelse af indeksfil og brug.

Funktioner:

 * FASTA-indeksoprettelse (.fai) for FASTA-filer
 * Sekvensudtrækning
 * Undersekvensudtrækning
 * Sekvensstatistik (i øjeblikket er kun entropi indeholdt)

Sekvens- og undersekvensudtrækning bruger fseek64 til at tilbyde hurtigst mulig udtrækning uden RAM-intensive operationer for filindlæsning. Dette gør fastahack til et nyttigt værktøj for bioinformatikere, som hurtigt skal udtrække mange undersekvenser fra en FASTA-referencesekvens.

Dette er udviklingspakken indeholdende det statisk lænkede bibliotek og teksthovedfilerne.

Tags: Software Development: Libraries, Role: Development Library

Other Packages Related to libfastahack-dev

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Download libfastahack-dev

Download for all available architectures
Architecture Package Size Installed Size Files
amd64 26.4 kB120.0 kB [list of files]
arm64 25.4 kB115.0 kB [list of files]
armel 27.5 kB110.0 kB [list of files]
armhf 27.8 kB98.0 kB [list of files]
i386 29.2 kB105.0 kB [list of files]
mips64el 29.2 kB143.0 kB [list of files]
mipsel 30.1 kB114.0 kB [list of files]
ppc64el 28.0 kB127.0 kB [list of files]
s390x 25.0 kB119.0 kB [list of files]