Package: pbbamtools (1.6.0+dfsg-2)

Links for pbbamtools

Debian Resources:

Download Source Package pbbam:

Maintainers:

External Resources:

Homepage [pbbam.readthedocs.org]

Similar packages:

Behandling af Pacific Biosciences binære sammenlignings-/oversættelsesfiler

BAM-formatet er et binært, komprimeret, postorienteret containerformat for rå eller sammenlignede sekvenslæsninger. Det associerede SAM-format er en tekstrepræsentation af de samme data. Specifikationerne for BAM/SAM vedligeholdes af SAM/BAM Format Specification Working Group.

PacBio-fremstillede BAM-filer er fuldt kompatible med BAM-specifikationen, men gør brug af udvidelsesmekanismer for BAM-specifikationen til at kode PacBio-specifik information.

Denne pakke tilbyder redskaber for kommandolinjen til arbejdet med PacBio BAM-filer.

Other Packages Related to pbbamtools

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libc6 (>= 2.17)

GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

GCC støttebibliotek
dep: libhts3 (>= 1.10)

C-bibliotek for høj-gennemløb sekvensdataformater
dep: libpbbam1.6.0 (= 1.6.0+dfsg-2)

Pacific Biosciences binære sammenlignings-/oversættelsesbibliotek (BAM)
dep: libpbcopper1.8.0 (>= 1.8.0+dfsg)

Datastrukturer, algoritmer og redskaber for C++-programmer
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

GNU Standard C++ bibliotek v3

rec: samtools

Forarbejdning af sekvensopstillinger i SAM-, BAM- og CRAM-formater

Download pbbamtools

Download for all available architectures
Architecture	Package Size	Installed Size	Files
arm64	81.3 kB	310.0 kB	[list of files]