Paquet : pbbamtools (1.6.0+dfsg-2)

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Paquets similaires :

processing Pacific Biosciences binary alignment/map files

The BAM format is a binary, compressed, record-oriented container format for raw or aligned sequence reads. The associated SAM format is a text representation of the same data. The specifications for BAM/SAM are maintained by the SAM/BAM Format Specification Working Group.

PacBio-produced BAM files are fully compatible with the BAM specification, but makes use of the extensibility mechanisms of the BAM specification to encode PacBio-specific information.

This package provides command-line utilities for working with PacBio BAM files.

Autres paquets associés à pbbamtools

dépendances

recommandations

suggestions

enhances

dep: libc6 (>= 2.17)

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

bibliothèque de prise en charge de GCC
dep: libhts3 (>= 1.10)

C library for high-throughput sequencing data formats
dep: libpbbam1.6.0 (= 1.6.0+dfsg-2)

Pacific Biosciences binary alignment/map (BAM) library
dep: libpbcopper1.8.0 (>= 1.8.0+dfsg)

data structures, algorithms, and utilities for C++ applications
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

bibliothèque standard C++ de GNU v3

rec: samtools

traitement d'alignements de séquence pour les formats SAM et BAM et CRAM

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
arm64	81,3 ko	310,0 ko	[liste des fichiers]