[ Source: stacks ]
Package: stacks (2.62+dfsg-1)
Links for stacks
Debian Resources:
Download Source Package stacks:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [creskolab.uoregon.edu]
Similar packages:
Datakanal for bygning af loci fra kort-læs DNA-sekvenser
Stacks er en programdatakanal for bygning af loci (specifik placering af et gen) fra kort-læs sekvenser, såsom dem oprettet på platformen Illumina. Stacks blev udviklet for at fungere med begrænsning af enzymbaserede data, såsom RAD-seq, med det formål at bygge genetiske kort og udføre forskning indenfor befolkningsgener og fylogeografi.
Bemærk at denne pakke installerer Stacks på en måde der gør, at alle kommandoer skal køres som: $ stacks <kommandonavn> <parametre>
Other Packages Related to stacks
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: libdbi-perl
- databasegrænseflade til Perl (DBI)
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4)
- GCC støttebibliotek
-
- dep: libgomp1 (>= 6)
- GCC OpenMP-understøttelsesbibliotek (GOMP)
-
- dep: libhts3 (>= 1.10)
- C-bibliotek for høj-gennemløb sekvensdataformater
-
- dep: libstdc++6 (>= 11)
- GNU Standard C++ bibliotek v3
-
- dep: samtools
- Forarbejdning af sekvensopstillinger i SAM-, BAM- og CRAM-formater
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)
- Komprimeringsbibliotek - kørselstid
-
- rec: libspreadsheet-writeexcel-perl
- module to create Excel spreadsheets
-
- rec: littler
- GNU R-brugerflade for skript og kommandolinje - overgangspakke
also a virtual package provided by r-cran-littler
-
- rec: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
Download stacks
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| ppc64el | 1,093.5 kB | 6,931.0 kB | [list of files] |