Пакет: python3-dna-jellyfish (2.3.1-3 и други)
Връзки за python3-dna-jellyfish
Ресурси за Debian:
- Доклади за грешки
- Developer Information
- Журнал на промените в Debian
- Авторски права
- Управление на кръпките в Debian
Изтегляне на пакет-източник jellyfish.
Отговорници:
- Debian Med Packaging Team (Страница за QA, Пощенски архив)
- Shaun Jackman (Страница за QA)
- Andreas Tille (Страница за QA)
- Michael R. Crusoe (Страница за QA)
- Étienne Mollier (Страница за QA)
Външни препратки:
- Начална страница [www.genome.umd.edu]
Подобни пакети:
count k-mers in DNA sequences (Python bindings of jellyfish)
JELLYFISH is a tool for fast, memory-efficient counting of k-mers in DNA. A k-mer is a substring of length k, and counting the occurrences of all such substrings is a central step in many analyses of DNA sequence. JELLYFISH can count k-mers using an order of magnitude less memory and an order of magnitude faster than other k-mer counting packages by using an efficient encoding of a hash table and by exploiting the "compare-and-swap" CPU instruction to increase parallelism.
JELLYFISH is a command-line program that reads FASTA and multi-FASTA files containing DNA sequences. It outputs its k-mer counts in an binary format, which can be translated into a human-readable text format using the "jellyfish dump" command.
This package contains the Python bindings of jellyfish.
Други пакети, свързани с python3-dna-jellyfish
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.38)
- GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не riscv64]
- GCC support library
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]
-
- dep: libjellyfish-2.0-2 (>= 2.3.1)
- count k-mers in DNA sequences (dynamic library of jellyfish)
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- GNU Standard C++ Library v3
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
- dep: python3 (<< 3.13)
- dep: python3 (>= 3.12~)
Изтегляне на python3-dna-jellyfish
Архитектура | Версия | Големина на пакета | Големина след инсталиране | Файлове |
---|---|---|---|---|
amd64 | 2.3.1-3+b5 | 54,1 кБ | 183,0 кБ | [списък на файловете] |
arm64 | 2.3.1-3+b5 | 51,6 кБ | 239,0 кБ | [списък на файловете] |
mips64el | 2.3.1-3+b5 | 51,6 кБ | 246,0 кБ | [списък на файловете] |
ppc64el | 2.3.1-3+b5 | 56,3 кБ | 239,0 кБ | [списък на файловете] |
riscv64 | 2.3.1-3+b5 | 55,2 кБ | 163,0 кБ | [списък на файловете] |