Пакет: pirs (2.0.2+dfsg-11)

Връзки за pirs

Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник pirs.

Отговорници:

Външни препратки:

Начална страница [github.com]

Подобни пакети:

Profile based Illumina pair-end Reads Simulator

The program pIRS can be used for simulating Illumina PE reads, with a series of characters generated by Illumina sequencing platform, such as insert size distribution, sequencing error(substitution, insertion, deletion), quality score and GC content-coverage bias.

The insert size follows a normal distribution, so users should set the mean value and standard deviation. Usually the standard deviation is set as 1/20 of the mean value. The normal distribution by Box-Muller method is simulated.

The program simulates sequencing error, quality score and GC content- coverage bias according to the empirical distribution profile. Some default profiles counted from lots of real sequencing data are provided.

To simulate reads from diploid genome, users should simulate the diploid genome sequence firstly by setting the ratio of heterozygosis SNP, heterozygosis InDel and structure variation.

Други пакети, свързани с pirs

зависимости

препоръчани

предложени

enhances

dep: fonts-liberation

Fonts with the same metrics as Times, Arial and Courier
dep: gnuplot

Command-line driven interactive plotting program.
също и виртуален пакет, предлаган от gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11
dep: libc6 (>= 2.29)

GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armel, armhf, i386, mipsel]

GCC support library

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]
dep: libgomp1 (>= 4.9)

GCC OpenMP (GOMP) support library
dep: libgzstream0 (>= 1.5+dfsg)

provide functionality of zlib C-library in a C++ iostream
dep: libstdc++6 (>= 11)

GNU Standard C++ Library v3
dep: pirs-profiles

profile basd Illumina pair-end Reads Simulator (profile data)
dep: zlib1g (>= 1:1.2.0.2)

compression library - runtime

Изтегляне на pirs

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
amd64	114,9 кБ	395,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	106,4 кБ	423,0 кБ	[списък на файловете]
armel	102,8 кБ	421,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	102,6 кБ	357,0 кБ	[списък на файловете]
i386	123,2 кБ	405,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	115,6 кБ	498,0 кБ	[списък на файловете]
mipsel	117,6 кБ	431,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	117,2 кБ	423,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	107,4 кБ	387,0 кБ	[списък на файловете]