Package: libfreecontact-perl (0.08-9 and others)
Links for libfreecontact-perl
Debian Resources:
Download Source Package libfreecontact-perl:
- [libfreecontact-perl_0.08-9.dsc]
- [libfreecontact-perl_0.08.orig.tar.gz]
- [libfreecontact-perl_0.08-9.debian.tar.xz]
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [rostlab.org]
Similar packages:
Hurtig protein-kontaktprædiktor - binding for Perl
FreeContact er en protein-kontaktrestprædiktor optimeret til hastighed. Dens indgang er en flersekvensopstilling. FreeContact kan fungere som en accelereret erstatning for de offentliggjorte kontaktprædiktorer EVfold-mfDCA af DS. Marks (2011) og PSICOV af D. Jones (2011).
FreeContact accelereres af en kombination af vektorinstruktioner, flere tråde og hurtigere gennemførelse af centrale dele. Afhængig af opstillingen er 8-fold eller højere hastighedsforøgelser mulige.
En tilstrækkelig stor tilpasning er påkrævet for meningsfulde resultater. Som minimum bør en opstilling med et effektivt (efter-vægtning) sekvensantal større end længden af søgesekvensen anvendes. Opstillinger med titusinder af (effektive) sekvenser betragtes som gode inddata.
Jackhmmer(1) fra hmmer-pakken eller hhblits(1) fra hhsuite kan anvendes til at oprette opstillingerne, f.eks.
Denne pakke indeholder Perlbindingen.
Other Packages Related to libfreecontact-perl
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: libfreecontact0t64 (>= 1.0.21)
- Hurtig protein-kontaktprædiktor - bibliotek
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf]
- GCC støttebibliotek
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
-
- dep: perl (>= 5.38.2-3.2)
- Larry Walls praktiske uddragnings- og rapportsprog (Perl)
-
- dep: perlapi-5.38.2 [not armel, armhf]
- virtual package provided by perl-base
-
- dep: perlapi-5.38.2t64 [armel, armhf]
- virtual package provided by perl-base
Download libfreecontact-perl
Architecture | Version | Package Size | Installed Size | Files |
---|---|---|---|---|
amd64 | 0.08-9+b4 | 62.3 kB | 213.0 kB | [list of files] |
arm64 | 0.08-9+b4 | 60.5 kB | 224.0 kB | [list of files] |
armel | 0.08-9+b4 | 60.8 kB | 204.0 kB | [list of files] |
armhf | 0.08-9+b4 | 59.8 kB | 192.0 kB | [list of files] |
i386 | 0.08-9+b4 | 62.7 kB | 216.0 kB | [list of files] |
mips64el | 0.08-9+b4 | 59.7 kB | 226.0 kB | [list of files] |
ppc64el | 0.08-9+b4 | 62.1 kB | 225.0 kB | [list of files] |
s390x | 0.08-9+b4 | 62.2 kB | 209.0 kB | [list of files] |