Package: libfreecontact-perl (0.08-7 and others)

Links for libfreecontact-perl

Debian Resources:

Download Source Package libfreecontact-perl:

Maintainers:

Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
Laszlo Kajan (QA Page)
Andreas Tille (QA Page)

External Resources:

Homepage [rostlab.org]

Similar packages:

Hurtig protein-kontaktprædiktor - binding for Perl

FreeContact er en protein-kontaktrestprædiktor optimeret til hastighed. Dens indgang er en flersekvensopstilling. FreeContact kan fungere som en accelereret erstatning for de offentliggjorte kontaktprædiktorer EVfold-mfDCA af DS. Marks (2011) og PSICOV af D. Jones (2011).

FreeContact accelereres af en kombination af vektorinstruktioner, flere tråde og hurtigere gennemførelse af centrale dele. Afhængig af opstillingen er 8-fold eller højere hastighedsforøgelser mulige.

En tilstrækkelig stor tilpasning er påkrævet for meningsfulde resultater. Som minimum bør en opstilling med et effektivt (efter-vægtning) sekvensantal større end længden af søgesekvensen anvendes. Opstillinger med titusinder af (effektive) sekvenser betragtes som gode inddata.

Jackhmmer(1) fra hmmer-pakken eller hhblits(1) fra hhsuite kan anvendes til at oprette opstillingerne, f.eks.

Denne pakke indeholder Perlbindingen.

Tags: Software Development: Perl Development, Libraries, Implemented in: implemented-in::c, implemented-in::perl, Role: Development Library

Other Packages Related to libfreecontact-perl

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

dep: libc6 (>= 2.4) [armhf, i386]
dep: libfreecontact0v5

Hurtig protein-kontaktprædiktor - bibliotek
dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [not armhf]

GCC støttebibliotek

dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armhf]
dep: perl (>= 5.28.0-3)

Larry Walls praktiske uddragnings- og rapportsprog (Perl)
dep: perlapi-5.28.0

virtual package provided by perl-base

Download libfreecontact-perl

Download for all available architectures
Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	0.08-7+b1	72.1 kB	136.0 kB	[list of files]
arm64	0.08-7+b1	71.1 kB	127.0 kB	[list of files]
armhf	0.08-7+b1	69.8 kB	115.0 kB	[list of files]
i386	0.08-7+b1	73.5 kB	143.0 kB	[list of files]