всички настройки
trixie  ] [  sid  ]
[ Източник: freecontact  ]

Пакет: libfreecontact0t64 (1.0.21-13.1 и други)

Връзки за libfreecontact0t64

Screenshot

Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник freecontact.

Отговорници:

Външни препратки:

Подобни пакети:

fast protein contact predictor library

FreeContact is a protein residue contact predictor optimized for speed. Its input is a multiple sequence alignment. FreeContact can function as an accelerated drop-in for the published contact predictors EVfold-mfDCA of DS. Marks (2011) and PSICOV of D. Jones (2011).

FreeContact is accelerated by a combination of vector instructions, multiple threads, and faster implementation of key parts. Depending on the alignment, 8-fold or higher speedups are possible.

A sufficiently large alignment is required for meaningful results. As a minimum, an alignment with an effective (after-weighting) sequence count bigger than the length of the query sequence should be used. Alignments with tens of thousands of (effective) sequences are considered good input.

jackhmmer(1) from the hmmer package, or hhblits(1) from hhsuite can be used to generate the alignments, for example.

This package contains the shared library implementing freecontact.

Други пакети, свързани с libfreecontact0t64

  • зависимости
  • препоръчани
  • предложени
  • enhances

Изтегляне на libfreecontact0t64

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура Версия Големина на пакета Големина след инсталиране Файлове
alpha (неофициална архитектура) 1.0.21-13.1+b1 73,4 кБ223,0 кБ [списък на файловете]
amd64 1.0.21-13.1+b1 78,4 кБ206,0 кБ [списък на файловете]
arm64 1.0.21-13.1+b1 69,2 кБ221,0 кБ [списък на файловете]
armel 1.0.21-13.1+b1 60,6 кБ165,0 кБ [списък на файловете]
armhf 1.0.21-13.1+b1 60,2 кБ133,0 кБ [списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура) 1.0.21-13.1 75,9 кБ200,0 кБ [списък на файловете]
i386 1.0.21-13.1+b1 66,5 кБ181,0 кБ [списък на файловете]
ia64 (неофициална архитектура) 1.0.21-13.1+b1 97,4 кБ319,0 кБ [списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура) 1.0.21-13.1+b1 60,6 кБ165,0 кБ [списък на файловете]
mips64el 1.0.21-13.1+b1 66,6 кБ228,0 кБ [списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура) 1.0.21-13.1+b1 75,9 кБ222,0 кБ [списък на файловете]
ppc64el 1.0.21-13.1+b1 84,5 кБ222,0 кБ [списък на файловете]
riscv64 1.0.21-13.1+b1 70,1 кБ149,0 кБ [списък на файловете]
s390x 1.0.21-13.1+b1 68,9 кБ206,0 кБ [списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура) 1.0.21-13.1 78,1 кБ220,0 кБ [списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура) 1.0.21-13.1+b2 60,5 кБ1 057,0 кБ [списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура) 1.0.21-13.1+b1 77,9 кБ197,0 кБ [списък на файловете]