Пакет: libfreecontact0t64 (1.0.21-13.1 и другие)

Ссылки для libfreecontact0t64

Ресурсы Debian:

Исходный код freecontact:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [rostlab.org]

Подобные пакеты:

fast protein contact predictor library

FreeContact is a protein residue contact predictor optimized for speed. Its input is a multiple sequence alignment. FreeContact can function as an accelerated drop-in for the published contact predictors EVfold-mfDCA of DS. Marks (2011) and PSICOV of D. Jones (2011).

FreeContact is accelerated by a combination of vector instructions, multiple threads, and faster implementation of key parts. Depending on the alignment, 8-fold or higher speedups are possible.

A sufficiently large alignment is required for meaningful results. As a minimum, an alignment with an effective (after-weighting) sequence count bigger than the length of the query sequence should be used. Alignments with tens of thousands of (effective) sequences are considered good input.

jackhmmer(1) from the hmmer package, or hhblits(1) from hhsuite can be used to generate the alignments, for example.

This package contains the shared library implementing freecontact.

Другие пакеты, относящиеся к libfreecontact0t64

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: libblas3

реализация алгоритмов линейной алгебры — библиотека

или libblas.so.3

виртуальный пакет, предоставляемый libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, ia64, sh4]

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armel, armhf, hppa, ia64, m68k]

вспомогательная библиотека GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

вспомогательная библиотека GCC
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

вспомогательная библиотека GCC
dep: libgfortran5 (>= 8)

Runtime library for GNU Fortran applications
dep: libgomp1 (>= 6)

вспомогательная библиотека GCC OpenMP (GOMP)
dep: liblapack3

библиотека подпрограмм линейной алгебры вер. 3 — динамическая версия

или liblapack.so.3

виртуальный пакет, предоставляемый libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
dep: libstdc++6 (>= 13.1)

стандартная библиотека GNU C++ версии 3
dep: libunwind8 [ia64]

library to determine the call-chain of a program - runtime

Загрузка libfreecontact0t64

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	1.0.21-13.1+b1	73,4 Кб	223,0 Кб	[список файлов]
amd64	1.0.21-13.1+b1	78,4 Кб	206,0 Кб	[список файлов]
arm64	1.0.21-13.1+b1	69,2 Кб	221,0 Кб	[список файлов]
armel	1.0.21-13.1+b1	60,6 Кб	165,0 Кб	[список файлов]
armhf	1.0.21-13.1+b1	60,2 Кб	133,0 Кб	[список файлов]
hppa (неофициальный перенос)	1.0.21-13.1	75,9 Кб	200,0 Кб	[список файлов]
i386	1.0.21-13.1+b1	66,5 Кб	181,0 Кб	[список файлов]
ia64 (неофициальный перенос)	1.0.21-13.1+b1	97,4 Кб	319,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	1.0.21-13.1+b1	60,6 Кб	165,0 Кб	[список файлов]
mips64el	1.0.21-13.1+b1	66,6 Кб	228,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	1.0.21-13.1+b1	75,9 Кб	222,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	1.0.21-13.1+b1	84,5 Кб	222,0 Кб	[список файлов]
riscv64	1.0.21-13.1+b1	70,1 Кб	149,0 Кб	[список файлов]
s390x	1.0.21-13.1+b1	68,9 Кб	206,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	1.0.21-13.1	78,1 Кб	220,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	1.0.21-13.1+b2	60,5 Кб	1 057,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	1.0.21-13.1+b1	77,9 Кб	197,0 Кб	[список файлов]