套件：ska（1.0+dfsg-4）

ska 的相關連結

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下載原始碼套件 ska：

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相似套件：

Split Kmer Analysis

SKA (Split Kmer Analysis) is a toolkit for prokaryotic (and any other small, haploid) DNA sequence analysis using split kmers. A split kmer is a pair of kmers in a DNA sequence that are separated by a single base. Split kmers allow rapid comparison and alignment of small genomes, and is particulalry suited for surveillance or outbreak investigation. SKA can produce split kmer files from fasta format assemblies or directly from fastq format read sequences, cluster them, align them with or without a reference sequence and provide various comparison and summary statistics. Currently all testing has been carried out on high-quality Illumina read data, so results for other platforms may vary.

其他與 ska 有關的套件

依賴

推薦

建議

增強

dep: libc6 (>= 2.34) [除 alpha, ia64, sh4]

GNU C 函式庫：共用函式庫
同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

GNU C 函式庫：共用函式庫
同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [arm64, ppc64el, s390x]

GCC 支援函式庫

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, amd64, mips64el, ppc64, riscv64, sh4, sparc64, x32]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

GCC 支援函式庫
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

GCC 支援函式庫
dep: libstdc++6 (>= 13.1)

GNU Standard C++ Library v3
dep: libunwind8 [ia64]

library to determine the call-chain of a program - runtime
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

壓縮函式庫 - 跑程式時用(runtime)

下載 ska

下載可用於所有硬體架構的
硬體架構	套件大小	安裝後大小	檔案
alpha （非官方移植版）	133。7 kB	543。0 kB	[檔案列表]
amd64	143。9 kB	451。0 kB	[檔案列表]
arm64	121。9 kB	415。0 kB	[檔案列表]
armel	119。9 kB	394。0 kB	[檔案列表]
armhf	124。9 kB	314。0 kB	[檔案列表]
hppa （非官方移植版）	138。9 kB	436。0 kB	[檔案列表]
i386	149。6 kB	482。0 kB	[檔案列表]
ia64 （非官方移植版）	175。0 kB	846。0 kB	[檔案列表]
m68k （非官方移植版）	117。8 kB	422。0 kB	[檔案列表]
mips64el	125。3 kB	514。0 kB	[檔案列表]
ppc64 （非官方移植版）	138。2 kB	545。0 kB	[檔案列表]
ppc64el	138。4 kB	543。0 kB	[檔案列表]
riscv64	140。4 kB	363。0 kB	[檔案列表]
s390x	142。4 kB	463。0 kB	[檔案列表]
sh4 （非官方移植版）	148。8 kB	414。0 kB	[檔案列表]
sparc64 （非官方移植版）	118。6 kB	1，122。0 kB	[檔案列表]
x32 （非官方移植版）	138。5 kB	426。0 kB	[檔案列表]