tüm seçenekler
bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Kaynak: ska  ]

Paket: ska (1.0+dfsg-4)

ska için bağlantılar

Screenshot

Debian Kaynakları:

ska Kaynak Paketini İndir:

Geliştiriciler:

Dış Kaynaklar:

Benzer paketler:

Split Kmer Analysis

SKA (Split Kmer Analysis) is a toolkit for prokaryotic (and any other small, haploid) DNA sequence analysis using split kmers. A split kmer is a pair of kmers in a DNA sequence that are separated by a single base. Split kmers allow rapid comparison and alignment of small genomes, and is particulalry suited for surveillance or outbreak investigation. SKA can produce split kmer files from fasta format assemblies or directly from fastq format read sequences, cluster them, align them with or without a reference sequence and provide various comparison and summary statistics. Currently all testing has been carried out on high-quality Illumina read data, so results for other platforms may vary.

ska ile İlgili Diğer Paketler

  • bağımlılıklar
  • tavsiye edilen
  • önerilen
  • enhances

ska indir

Tüm mevcut mimariler için indir
Mimari Paket Boyutu Kurulu Boyut Dosyalar
alpha (resmi olmayan port) 133,7 kB543,0 kB [dosya listesi]
amd64 143,9 kB451,0 kB [dosya listesi]
arm64 121,9 kB415,0 kB [dosya listesi]
armel 119,9 kB394,0 kB [dosya listesi]
armhf 124,9 kB314,0 kB [dosya listesi]
hppa (resmi olmayan port) 138,9 kB436,0 kB [dosya listesi]
i386 149,6 kB482,0 kB [dosya listesi]
ia64 (resmi olmayan port) 175,0 kB846,0 kB [dosya listesi]
m68k (resmi olmayan port) 117,8 kB422,0 kB [dosya listesi]
mips64el 125,3 kB514,0 kB [dosya listesi]
ppc64 (resmi olmayan port) 138,2 kB545,0 kB [dosya listesi]
ppc64el 138,4 kB543,0 kB [dosya listesi]
riscv64 140,4 kB363,0 kB [dosya listesi]
s390x 142,4 kB463,0 kB [dosya listesi]
sh4 (resmi olmayan port) 148,8 kB414,0 kB [dosya listesi]
sparc64 (resmi olmayan port) 118,6 kB1.122,0 kB [dosya listesi]
x32 (resmi olmayan port) 138,5 kB426,0 kB [dosya listesi]