套件：murasaki-mpi（1.68.6-13 以及其他的）

murasaki-mpi 的相關連結

Debian 的資源：

下載原始碼套件 murasaki：

維護小組：

外部的資源：

主頁 [murasaki.dna.bio.keio.ac.jp]

相似套件：

homology detection tool across multiple large genomes (MPI-version)

Murasaki is a scalable and fast, language theory-based homology detection tool across multiple large genomes. It enable whole-genome scale multiple genome global alignments. Supports unlimited length gapped-seed patterns and unique TF-IDF based filtering.

Murasaki is an anchor alignment software, which is

 * exteremely fast (17 CPU hours for whole Human x Mouse genome (with
   40 nodes: 52 wall minutes))
 * scalable (Arbitrarily parallelizable across multiple nodes using MPI.
   Even a single node with 16GB of ram can handle over 1Gbp of sequence.)
 * unlimited pattern length
 * repeat tolerant
 * intelligent noise reduction

This package provides the MPI-enabled binary for murasaki. While this will speed up operation on multi-processor machines it will slow down on a single processor.

其他與 murasaki-mpi 有關的套件

依賴

推薦

建議

增強

dep: libboost-filesystem1.74.0 (>= 1.74.0) [sparc64]

filesystem operations (portable paths, iteration over directories, etc) in C++

dep: libboost-filesystem1.74.0 (>= 1.74.0+ds1) [x32]
dep: libboost-filesystem1.83.0 (>= 1.83.0) [除 sparc64, x32]

filesystem operations (portable paths, iteration over directories, etc) in C++
dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0) [sparc64]

Boost.Iostreams Library

dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0+ds1) [x32]
dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0) [除 sparc64, x32]

Boost.Iostreams Library
dep: libboost-regex1.74.0-icu67 [sparc64]

套件暫時不可用
dep: libboost-regex1.74.0-icu72 [x32]

本虛擬套件由這些套件填實： libboost-regex1.74.0
dep: libboost-system1.74.0 (>= 1.74.0) [sparc64]

Operating system (e.g. diagnostics support) library
dep: libc6 (>= 2.29) [sparc64]

GNU C 函式庫：共用函式庫
同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.34) [除 alpha, ia64, sh4, sparc64]

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

GNU C 函式庫：共用函式庫
同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libcrypto++6 [sparc64]

套件暫時不可用
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

GCC 支援函式庫

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

dep: libgcc-s1 (>= 4.3) [sparc64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

GCC 支援函式庫
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

GCC 支援函式庫
dep: libopenmpi3 (>= 4.0.5) [sparc64]

high performance message passing library -- shared library
dep: libopenmpi3t64 (>= 4.1.6) [除 sparc64]

high performance message passing library -- shared library
dep: libstdc++6 (>= 13.1) [除 sparc64]

GNU Standard C++ Library v3

dep: libstdc++6 (>= 5.2) [sparc64]
dep: libunwind8 [ia64]

library to determine the call-chain of a program - runtime
dep: murasaki-common

homology detection tool across multiple large genomes (common files)

下載 murasaki-mpi

下載可用於所有硬體架構的
硬體架構	版本	套件大小	安裝後大小	檔案
alpha （非官方移植版）	1.68.6-13+b5	694。7 kB	5，701。0 kB	[檔案列表]
amd64	1.68.6-13+b5	725。1 kB	5，095。0 kB	[檔案列表]
arm64	1.68.6-13+b5	630。7 kB	5，159。0 kB	[檔案列表]
armel	1.68.6-13+b5	481。5 kB	3，423。0 kB	[檔案列表]
armhf	1.68.6-13+b5	495。5 kB	2，415。0 kB	[檔案列表]
hppa （非官方移植版）	1.68.6-13+b5	698。5 kB	4，822。0 kB	[檔案列表]
i386	1.68.6-13+b5	737。6 kB	4，803。0 kB	[檔案列表]
ia64 （非官方移植版）	1.68.6-13+b5	766。7 kB	9，658。0 kB	[檔案列表]
m68k （非官方移植版）	1.68.6-13+b5	590。5 kB	4，246。0 kB	[檔案列表]
mips64el	1.68.6-13+b5	688。8 kB	6，877。0 kB	[檔案列表]
ppc64 （非官方移植版）	1.68.6-13+b5	715。8 kB	7，143。0 kB	[檔案列表]
ppc64el	1.68.6-13+b4	719。3 kB	6，503。0 kB	[檔案列表]
riscv64	1.68.6-13+b3	676。6 kB	3，970。0 kB	[檔案列表]
s390x	1.68.6-13+b4	707。7 kB	5，742。0 kB	[檔案列表]
sh4 （非官方移植版）	1.68.6-13+b4	614。4 kB	4，250。0 kB	[檔案列表]
sparc64 （非官方移植版）	1.68.6-11	517。7 kB	3，959。0 kB	[檔案列表]
x32 （非官方移植版）	1.68.6-13+b5	583。0 kB	3，388。0 kB	[檔案列表]