Balík: murasaki-mpi (1.68.6-13 a iné)
Odkazy pre murasaki-mpi
Zdroje Debian:
Stiahnuť zdrojový balík murasaki:
- [murasaki_1.68.6-13.dsc]
- [murasaki_1.68.6.orig-debian-tests-data.tar.gz]
- [murasaki_1.68.6.orig.tar.gz]
- [murasaki_1.68.6-13.debian.tar.xz]
Správcovia:
- Debian Med Packaging Team (Stránka QA, Konferencia)
- Andreas Tille (Stránka QA)
- Nilesh Patra (Stránka QA)
Externé zdroje:
- Domovská stránka [murasaki.dna.bio.keio.ac.jp]
Podobné balíky:
homology detection tool across multiple large genomes (MPI-version)
Murasaki is a scalable and fast, language theory-based homology detection tool across multiple large genomes. It enable whole-genome scale multiple genome global alignments. Supports unlimited length gapped-seed patterns and unique TF-IDF based filtering.
Murasaki is an anchor alignment software, which is
* exteremely fast (17 CPU hours for whole Human x Mouse genome (with 40 nodes: 52 wall minutes)) * scalable (Arbitrarily parallelizable across multiple nodes using MPI. Even a single node with 16GB of ram can handle over 1Gbp of sequence.) * unlimited pattern length * repeat tolerant * intelligent noise reduction
This package provides the MPI-enabled binary for murasaki. While this will speed up operation on multi-processor machines it will slow down on a single processor.
Ostatné balíky súvisiace s balíkom murasaki-mpi
|
|
|
|
-
- dep: libboost-filesystem1.74.0 (>= 1.74.0) [sparc64]
- operácie so súborovým systémom (portabilné cesty, prechádzanie adresárov atď.) v C++
-
- dep: libboost-filesystem1.83.0 (>= 1.83.0) [nie sparc64]
- operácie so súborovým systémom (portabilné cesty, prechádzanie adresárov atď.) v C++
-
- dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0) [sparc64]
- knižnica Boost.Iostreams
-
- dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0) [nie sparc64]
- knižnica Boost.Iostreams
-
- dep: libboost-regex1.74.0-icu67 [sparc64]
- Balík nie je dostupný
-
- dep: libboost-system1.74.0 (>= 1.74.0) [sparc64]
- knižnica operačného systému (napr. podpora diagnostiky)
-
- dep: libc6 (>= 2.29) [sparc64]
- knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, ia64, sh4, sparc64, x32]
- dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
- dep: libc6 (>= 2.38) [x32]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
-
- dep: libcrypto++6 [sparc64]
- Balík nie je dostupný
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]
- podporná knižnica GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.3) [sparc64]
-
- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]
- podporná knižnica GCC
-
- dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]
- podporná knižnica GCC
-
- dep: libopenmpi3 (>= 4.0.5) [sparc64]
- knižnica na vyskokovýkonné odovzdávanie správ - zdieľaná knižnica
-
- dep: libopenmpi3t64 (>= 4.1.6) [nie sparc64]
- knižnica na vyskokovýkonné odovzdávanie správ - zdieľaná knižnica
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1) [nie sparc64, x32]
- štandardná knižnica C++ GNU v3
- dep: libstdc++6 (>= 14) [x32]
- dep: libstdc++6 (>= 5.2) [sparc64]
-
- dep: libunwind8 [ia64]
- nnižnica na určenie na určenie postupnosti volania programu - dynamické súbory
-
- dep: murasaki-common
- homology detection tool across multiple large genomes (common files)
Stiahnuť murasaki-mpi
Architektúra | Verzia | Veľkosť balíka | Nainštalovaná veľkosť | Súbory |
---|---|---|---|---|
alpha (neoficiálny port) | 1.68.6-13+b5 | 694.7 kB | 5,701.0 kB | [zoznam súborov] |
amd64 | 1.68.6-13+b5 | 725.1 kB | 5,095.0 kB | [zoznam súborov] |
arm64 | 1.68.6-13+b5 | 630.7 kB | 5,159.0 kB | [zoznam súborov] |
armel | 1.68.6-13+b5 | 481.5 kB | 3,423.0 kB | [zoznam súborov] |
armhf | 1.68.6-13+b5 | 495.5 kB | 2,415.0 kB | [zoznam súborov] |
hppa (neoficiálny port) | 1.68.6-13+b5 | 698.5 kB | 4,822.0 kB | [zoznam súborov] |
i386 | 1.68.6-13+b5 | 737.6 kB | 4,803.0 kB | [zoznam súborov] |
ia64 (neoficiálny port) | 1.68.6-13+b5 | 766.7 kB | 9,658.0 kB | [zoznam súborov] |
m68k (neoficiálny port) | 1.68.6-13+b5 | 590.5 kB | 4,246.0 kB | [zoznam súborov] |
mips64el | 1.68.6-13+b5 | 688.8 kB | 6,877.0 kB | [zoznam súborov] |
ppc64 (neoficiálny port) | 1.68.6-13+b5 | 715.8 kB | 7,143.0 kB | [zoznam súborov] |
ppc64el | 1.68.6-13+b4 | 719.3 kB | 6,503.0 kB | [zoznam súborov] |
riscv64 | 1.68.6-13+b3 | 676.6 kB | 3,970.0 kB | [zoznam súborov] |
s390x | 1.68.6-13+b4 | 707.7 kB | 5,742.0 kB | [zoznam súborov] |
sh4 (neoficiálny port) | 1.68.6-13+b4 | 614.4 kB | 4,250.0 kB | [zoznam súborov] |
sparc64 (neoficiálny port) | 1.68.6-11 | 517.7 kB | 3,959.0 kB | [zoznam súborov] |
x32 (neoficiálny port) | 1.68.6-13+b6 | 709.0 kB | 4,602.0 kB | [zoznam súborov] |