[ 原始碼: pairtools ]
套件:python3-pairtools-examples(1.0.3-1 以及其他的)
Process sequencing data from a Hi-C experiment (examples)
Simple and fast command-line framework to process sequencing data from a Hi-C experiment.
Process pair-end sequence alignments and perform the following operations:
- Detect ligation junctions (a.k.a. Hi-C pairs) in aligned paired-end sequences of Hi-C DNA molecules - Sort .pairs files for downstream analyses - Detect, tag and remove PCR/optical duplicates - Generate extensive statistics of Hi-C datasets - Select Hi-C pairs given flexibly defined criteria - Restore .sam alignments from Hi-C pairs
This package contains some examples
其他與 python3-pairtools-examples 有關的套件
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- enh: python3-pairtools
- Framework to process sequencing data from a Hi-C experiment
下載 python3-pairtools-examples
硬體架構 | 版本 | 套件大小 | 安裝後大小 | 檔案 |
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alpha (非官方移植版) | 1.0.3-1 | 790。0 kB | 843。0 kB | [檔案列表] |
amd64 | 1.0.3-1 | 790。0 kB | 843。0 kB | [檔案列表] |
arm64 | 1.0.3-1 | 790。0 kB | 843。0 kB | [檔案列表] |
armel | 1.0.3-1 | 790。0 kB | 843。0 kB | [檔案列表] |
armhf | 1.0.3-1 | 790。0 kB | 843。0 kB | [檔案列表] |
hppa (非官方移植版) | 0.3.0-3.2+b2 | 12。1 kB | 50。0 kB | [檔案列表] |
i386 | 1.0.3-1 | 790。0 kB | 843。0 kB | [檔案列表] |
ia64 (非官方移植版) | 0.3.0-3.2+b1 | 12。1 kB | 50。0 kB | [檔案列表] |
m68k (非官方移植版) | 1.0.3-1 | 790。0 kB | 843。0 kB | [檔案列表] |
mips64el | 1.0.3-1 | 790。0 kB | 843。0 kB | [檔案列表] |
ppc64 (非官方移植版) | 0.3.0-3.2+b2 | 12。1 kB | 50。0 kB | [檔案列表] |
ppc64el | 1.0.3-1 | 790。0 kB | 843。0 kB | [檔案列表] |
riscv64 | 1.0.3-1 | 790。0 kB | 843。0 kB | [檔案列表] |
sh4 (非官方移植版) | 1.0.3-1+b1 | 790。3 kB | 844。0 kB | [檔案列表] |
sparc64 (非官方移植版) | 0.3.0-3.2+b2 | 12。1 kB | 50。0 kB | [檔案列表] |
x32 (非官方移植版) | 0.3.0-3.2+b1 | 12。1 kB | 50。0 kB | [檔案列表] |