všetky možnosti
[  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Zdroj: pairtools  ]

Balík: python3-pairtools-examples (1.0.3-1 a iné)

Odkazy pre python3-pairtools-examples

Screenshot

Zdroje Debian:

Stiahnuť zdrojový balík pairtools:

Správcovia:

Externé zdroje:

Podobné balíky:

Process sequencing data from a Hi-C experiment (examples)

Simple and fast command-line framework to process sequencing data from a Hi-C experiment.

Process pair-end sequence alignments and perform the following operations: 

  - Detect ligation junctions (a.k.a. Hi-C pairs) in aligned paired-end
    sequences of Hi-C DNA molecules
  - Sort .pairs files for downstream analyses
  - Detect, tag and remove PCR/optical duplicates
  - Generate extensive statistics of Hi-C datasets
  - Select Hi-C pairs given flexibly defined criteria
  - Restore .sam alignments from Hi-C pairs

This package contains some examples

Ostatné balíky súvisiace s balíkom python3-pairtools-examples

  • závisí
  • odporúča
  • navrhuje
  • vylepšuje

Stiahnuť python3-pairtools-examples

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra Verzia Veľkosť balíka Nainštalovaná veľkosť Súbory
alpha (neoficiálny port) 1.0.3-1+b1 790.3 kB844.0 kB [zoznam súborov]
amd64 1.0.3-1+b2 790.3 kB844.0 kB [zoznam súborov]
arm64 1.0.3-1+b2 790.3 kB844.0 kB [zoznam súborov]
armel 1.0.3-1+b2 790.3 kB844.0 kB [zoznam súborov]
armhf 1.0.3-1+b2 790.3 kB844.0 kB [zoznam súborov]
hppa (neoficiálny port) 0.3.0-3.2+b2 12.1 kB50.0 kB [zoznam súborov]
i386 1.0.3-1+b2 790.3 kB844.0 kB [zoznam súborov]
ia64 (neoficiálny port) 0.3.0-3.2+b1 12.1 kB50.0 kB [zoznam súborov]
m68k (neoficiálny port) 1.0.3-1 790.0 kB843.0 kB [zoznam súborov]
mips64el 1.0.3-1+b2 790.3 kB844.0 kB [zoznam súborov]
ppc64 (neoficiálny port) 0.3.0-3.2+b2 12.1 kB50.0 kB [zoznam súborov]
ppc64el 1.0.3-1+b2 790.3 kB844.0 kB [zoznam súborov]
riscv64 1.0.3-1+b2 790.3 kB844.0 kB [zoznam súborov]
sh4 (neoficiálny port) 1.0.3-1+b1 790.3 kB844.0 kB [zoznam súborov]
sparc64 (neoficiálny port) 0.3.0-3.2+b2 12.1 kB50.0 kB [zoznam súborov]
x32 (neoficiálny port) 0.3.0-3.2+b1 12.1 kB50.0 kB [zoznam súborov]