套件：mira-assembler（4.9.6-11 以及其他的）

mira-assembler 的相關連結

Debian 的資源：

下載原始碼套件 mira：

維護小組：

外部的資源：

主頁 [sourceforge.net]

相似套件：

Whole Genome Shotgun and EST Sequence Assembler

The mira genome fragment assembler is a specialised assembler for sequencing projects classified as 'hard' due to high number of similar repeats. For expressed sequence tags (ESTs) transcripts, miraEST is specialised on reconstructing pristine mRNA transcripts while detecting and classifying single nucleotide polymorphisms (SNP) occurring in different variations thereof.

The assembler is routinely used for such various tasks as mutation detection in different cell types, similarity analysis of transcripts between organisms, and pristine assembly of sequences from various sources for oligo design in clinical microarray experiments.

The package provides the following executables: Binaries provided:

 * mira: for assembly of genome sequences
 * miramem: estimating memory needed to assemble projects.
 * mirabait: a "grep" like tool to select reads with kmers up to 256 bases.
 * miraconvert: is a tool to convert, extract and sometimes recalculate all
   kinds of data related to sequence assembly files.

標籤: 角色: 程式

其他與 mira-assembler 有關的套件

依賴

推薦

建議

增強

dep: libboost-filesystem1.83.0 (>= 1.83.0)

filesystem operations (portable paths, iteration over directories, etc) in C++
dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0) [sparc64]

Boost.Iostreams Library
dep: libboost-regex1.83.0-icu72 [sparc64]

本虛擬套件由這些套件填實： libboost-regex1.83.0
dep: libboost-system1.83.0 (>= 1.83.0) [sparc64]

Operating system (e.g. diagnostics support) library
dep: libboost-thread1.83.0 (>= 1.83.0)

portable C++ multi-threading
dep: libbz2-1.0 [sparc64]

high-quality block-sorting file compressor library - runtime
dep: libc6 (>= 2.34) [除 alpha, arm64, ia64, sh4, x32]

GNU C 函式庫：共用函式庫
同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.38) [arm64, x32]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

GNU C 函式庫：共用函式庫
同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libexpat1 (>= 2.0.1)

XML parsing C library - runtime library
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

GCC 支援函式庫

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, sparc64]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64, sh4]

dep: libgcc-s1 (>= 4.3) [riscv64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

GCC 支援函式庫
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

GCC 支援函式庫
dep: libgomp1 (>= 4.9)

GCC OpenMP (GOMP) support library
dep: libstdc++6 (>= 13.1) [除 arm64, x32]

GNU Standard C++ Library v3

dep: libstdc++6 (>= 14) [arm64, x32]
dep: libunwind8 [ia64]

library to determine the call-chain of a program - runtime
dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)

壓縮函式庫 - 跑程式時用(runtime)

rec: mira-rfam-12s-rrna

extract of RFAM 12 rRNA database

sug: mira-doc

documentation for the mira assembler

下載 mira-assembler

下載可用於所有硬體架構的
硬體架構	版本	套件大小	安裝後大小	檔案
alpha （非官方移植版）	4.9.6-11	2，591。6 kB	8，357。0 kB	[檔案列表]
amd64	4.9.6-11	2，507。6 kB	7，996。0 kB	[檔案列表]
arm64	4.9.6-11+b1	2，357。3 kB	7，264。0 kB	[檔案列表]
armel	4.9.6-11	2，145。5 kB	7，031。0 kB	[檔案列表]
armhf	4.9.6-11	2，102。0 kB	5，119。0 kB	[檔案列表]
hppa （非官方移植版）	4.9.6-11	2，454。6 kB	7，599。0 kB	[檔案列表]
i386	4.9.6-11	2，401。7 kB	8，227。0 kB	[檔案列表]
ia64 （非官方移植版）	4.9.6-11	3，535。0 kB	14，730。0 kB	[檔案列表]
m68k （非官方移植版）	4.9.6-11	2，175。7 kB	7，707。0 kB	[檔案列表]
mips64el	4.9.6-11	2，301。6 kB	8，737。0 kB	[檔案列表]
ppc64 （非官方移植版）	4.9.6-11	2，395。3 kB	8，224。0 kB	[檔案列表]
ppc64el	4.9.6-11	2，535。8 kB	8，096。0 kB	[檔案列表]
riscv64	4.9.6-11	2，690。3 kB	6，472。0 kB	[檔案列表]
s390x	4.9.6-11	1，967。3 kB	7，400。0 kB	[檔案列表]
sh4 （非官方移植版）	4.9.6-11	2，911。8 kB	6，749。0 kB	[檔案列表]
sparc64 （非官方移植版）	4.9.6-11	1，985。1 kB	7，338。0 kB	[檔案列表]
x32 （非官方移植版）	4.9.6-11+b1	2，747。6 kB	8，599。0 kB	[檔案列表]