软件包：fastqtl（2.184+v7+dfsg-4 以及其他的）

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主页 [fastqtl.sourceforge.net]

相似软件包：

Quantitative Trait Loci (QTL) mapper in cis for molecular phenotypes

The goal of FastQTL is to identify single-nucleotide polymorphisms (SNPs) which are significantly associated with various molecular phenotypes (i.e. expression of known genes, cytosine methylation levels, etc). It performs scans for all possible phenotype-variant pairs in cis (i.e. variants located within a specific window around a phenotype). FastQTL implements a new permutation scheme (Beta approximation) to accurately and rapidly correct for multiple-testing at both the genotype and phenotype levels.

标签: 领域: 生物学, 生物信息学, 用户接口: interface::commandline, role::program, Purpose: Analysing

其他与 fastqtl 有关的软件包

依赖

推荐

建议

增强

dep: libblas3

Basic Linear Algebra Reference implementations, shared library

或者 libblas.so.3

本虚包由这些包填实： libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0+ds1) [x32]

Boost.Iostreams Library
dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0) [除 x32]

Boost.Iostreams Library
dep: libboost-program-options1.74.0 (>= 1.74.0+ds1) [x32]

program options library for C++
dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0) [除 x32]

program options library for C++
dep: libbz2-1.0 [sparc64]

高品质块排序文件压缩程序库 - 运行时库
dep: libc6 (>= 2.34) [除 alpha, ia64, sh4]

GNU C 语言运行库：共享库
同时作为一个虚包由这些包填实： libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

GNU C 语言运行库：共享库
同时作为一个虚包由这些包填实： libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

GCC 支持库

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

GCC 支持库
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

GCC 支持库
dep: libgsl27 (>= 2.7.1)

GNU Scientific Library (GSL) -- library package
dep: libgslcblas0 (>= 2.7.1) [sparc64]

GNU Scientific Library (GSL) -- blas library package
dep: libhts3t64 (>= 1.17)

C library for high-throughput sequencing data formats
dep: libstdc++6 (>= 13.1)

GNU 标准 C++ 库，第3版
dep: libunwind8 [ia64]

library to determine the call-chain of a program - runtime
dep: python3

交互式高级面向对象语言（默认 python3 版本）
dep: r-mathlib (>= 4.3.2) [armel, armhf]

GNU R standalone mathematics library

dep: r-mathlib (>= 4.3.3) [除 armel, armhf]
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [sparc64]

压缩库 - 运行时

rec: r-cran-argparser

GNU R command-line argument parser
rec: r-cran-qvalue

软件包暂时不可用
rec: r-cran-tools

软件包暂时不可用

sug: fastqtl-doc

QTL mapper in cis for molecular phenotypes - documentation

下载 fastqtl

下载可用于所有硬件架构的
硬件架构	版本	软件包大小	安装后大小	文件
alpha （非官方移植版）	2.184+v7+dfsg-4+b3	194.2 kB	793.0 kB	[文件列表]
amd64	2.184+v7+dfsg-4+b2	232.5 kB	778.0 kB	[文件列表]
arm64	2.184+v7+dfsg-4+b2	197.3 kB	726.0 kB	[文件列表]
armel	2.184+v7+dfsg-4+b2	185.5 kB	661.0 kB	[文件列表]
armhf	2.184+v7+dfsg-4+b2	186.5 kB	493.0 kB	[文件列表]
hppa （非官方移植版）	2.184+v7+dfsg-4+b2	198.7 kB	648.0 kB	[文件列表]
i386	2.184+v7+dfsg-4+b2	230.8 kB	757.0 kB	[文件列表]
ia64 （非官方移植版）	2.184+v7+dfsg-4+b2	252.5 kB	1,260.0 kB	[文件列表]
m68k （非官方移植版）	2.184+v7+dfsg-4+b2	206.0 kB	717.0 kB	[文件列表]
mips64el	2.184+v7+dfsg-4+b2	194.0 kB	887.0 kB	[文件列表]
ppc64 （非官方移植版）	2.184+v7+dfsg-4+b2	212.1 kB	854.0 kB	[文件列表]
ppc64el	2.184+v7+dfsg-4+b2	243.0 kB	918.0 kB	[文件列表]
riscv64	2.184+v7+dfsg-4+b2	208.7 kB	578.0 kB	[文件列表]
s390x	2.184+v7+dfsg-4+b2	217.2 kB	754.0 kB	[文件列表]
sh4 （非官方移植版）	2.184+v7+dfsg-4+b2	257.2 kB	726.0 kB	[文件列表]
sparc64 （非官方移植版）	2.184+v7+dfsg-4+b2	173.3 kB	1,116.0 kB	[文件列表]
x32 （非官方移植版）	2.184+v7+dfsg-4+b2	232.8 kB	733.0 kB	[文件列表]