Pakiet: fastqtl (2.184+v7+dfsg-4 i inne)

Odnośniki dla fastqtl

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego fastqtl:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [fastqtl.sourceforge.net]

Podobne pakiety:

Quantitative Trait Loci (QTL) mapper in cis for molecular phenotypes

The goal of FastQTL is to identify single-nucleotide polymorphisms (SNPs) which are significantly associated with various molecular phenotypes (i.e. expression of known genes, cytosine methylation levels, etc). It performs scans for all possible phenotype-variant pairs in cis (i.e. variants located within a specific window around a phenotype). FastQTL implements a new permutation scheme (Beta approximation) to accurately and rapidly correct for multiple-testing at both the genotype and phenotype levels.

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Bioinformatyka, Interfejs użytkownika: interface::commandline, role::program, Przeznaczenie: Analizowanie

Inne pakiety związane z fastqtl

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libblas3

Implementacje Basic Linear Algebra Reference, biblioteka współdzielona

lub libblas.so.3

pakiet wirtualny udostępniany przez libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0+ds1) [x32]

Biblioteka Boost.Iostreams
dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0) [nie x32]

Biblioteka Boost.Iostreams
dep: libboost-program-options1.74.0 (>= 1.74.0+ds1) [x32]

program options library for C++
dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0) [nie x32]

program options library for C++
dep: libbz2-1.0 [sparc64]

Wysokiej jakości biblioteka kompresji plików - wersja uruchomieniowa
dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, ia64, sh4]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

Biblioteka wspomagająca GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

Biblioteka wspomagająca GCC
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

Biblioteka wspomagająca GCC
dep: libgsl27 (>= 2.7.1)

GNU Scientific Library (GSL) -- library package
dep: libgslcblas0 (>= 2.7.1) [sparc64]

GNU Scientific Library (GSL) -- blas library package
dep: libhts3t64 (>= 1.17)

C library for high-throughput sequencing data formats
dep: libstdc++6 (>= 13.1)

Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3
dep: libunwind8 [ia64]

Biblioteka do ustalania łańcucha wywołań programu - środowisko uruchomieniowe
dep: python3

Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)
dep: r-mathlib (>= 4.3.2) [armel, armhf]

GNU R standalone mathematics library

dep: r-mathlib (>= 4.3.3) [nie armel, armhf]
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [sparc64]

Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

rec: r-cran-argparser

GNU R command-line argument parser
rec: r-cran-qvalue

Pakiet niedostępny
rec: r-cran-tools

Pakiet niedostępny

sug: fastqtl-doc

QTL mapper in cis for molecular phenotypes - documentation

Pobieranie fastqtl

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	2.184+v7+dfsg-4+b3	194,2 KiB	793,0 KiB	[lista plików]
amd64	2.184+v7+dfsg-4+b2	232,5 KiB	778,0 KiB	[lista plików]
arm64	2.184+v7+dfsg-4+b2	197,3 KiB	726,0 KiB	[lista plików]
armel	2.184+v7+dfsg-4+b2	185,5 KiB	661,0 KiB	[lista plików]
armhf	2.184+v7+dfsg-4+b2	186,5 KiB	493,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	2.184+v7+dfsg-4+b2	198,7 KiB	648,0 KiB	[lista plików]
i386	2.184+v7+dfsg-4+b2	230,8 KiB	757,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	2.184+v7+dfsg-4+b2	252,5 KiB	1 260,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	2.184+v7+dfsg-4+b2	206,0 KiB	717,0 KiB	[lista plików]
mips64el	2.184+v7+dfsg-4+b2	194,0 KiB	887,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	2.184+v7+dfsg-4+b2	212,1 KiB	854,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	2.184+v7+dfsg-4+b2	243,0 KiB	918,0 KiB	[lista plików]
riscv64	2.184+v7+dfsg-4+b2	208,7 KiB	578,0 KiB	[lista plików]
s390x	2.184+v7+dfsg-4+b2	217,2 KiB	754,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	2.184+v7+dfsg-4+b2	257,2 KiB	726,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	2.184+v7+dfsg-4+b2	173,3 KiB	1 116,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	2.184+v7+dfsg-4+b2	232,8 KiB	733,0 KiB	[lista plików]