[ Source: srst2 ]
Пакунок: srst2 (0.2.0-13 and others)
Links for srst2
Debian Resources:
Download Source Package srst2:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [katholt.github.io]
Similar packages:
Short Read Sequence Typing for Bacterial Pathogens
This program is designed to take Illumina sequence data, a MLST database and/or a database of gene sequences (e.g. resistance genes, virulence genes, etc) and report the presence of STs and/or reference genes.
Інші пакунки пов'язані з srst2
|
|
|
|
-
- dep: bowtie2
- ultrafast memory-efficient short read aligner
-
- dep: cd-hit
- suite of programs designed to quickly group sequences
-
- dep: python [hppa, x32]
- Пакунок недоступний
-
- dep: python-biopython [hppa, x32]
- Python library for bioinformatics (implemented in Python 2)
-
- dep: python-scipy [hppa, x32]
- Пакунок недоступний
-
- dep: python3 [not hppa, x32]
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
-
- dep: python3-biopython [not hppa, x32]
- Python3 library for bioinformatics
-
- dep: python3-scipy [not hppa, x32]
- scientific tools for Python 3
-
- dep: samtools
- processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
-
- rec: python3-rpy2
- Python3 interface to the GNU R language and environment (version 2)
Завантажити srst2
| Архітектура | Версія | Розмір пакунка | Розмір після встановлення | Файли |
|---|---|---|---|---|
| alpha (unofficial port) | 0.2.0-13 | 59.8 kB | 265.0 kB | [список файлів] |
| amd64 | 0.2.0-13 | 59.9 kB | 265.0 kB | [список файлів] |
| arm64 | 0.2.0-13 | 59.9 kB | 265.0 kB | [список файлів] |
| hppa (unofficial port) | 0.1.8-1 | 58.6 kB | 258.0 kB | [список файлів] |
| ia64 (unofficial port) | 0.2.0-11 | 59.6 kB | 254.0 kB | [список файлів] |
| m68k (unofficial port) | 0.2.0-13 | 59.9 kB | 265.0 kB | [список файлів] |
| mips64el | 0.2.0-13 | 59.9 kB | 265.0 kB | [список файлів] |
| ppc64 (unofficial port) | 0.2.0-13 | 59.8 kB | 265.0 kB | [список файлів] |
| ppc64el | 0.2.0-13 | 59.9 kB | 265.0 kB | [список файлів] |
| riscv64 | 0.2.0-13 | 59.9 kB | 265.0 kB | [список файлів] |
| sh4 (unofficial port) | 0.2.0-13 | 59.8 kB | 265.0 kB | [список файлів] |
| sparc64 (unofficial port) | 0.2.0-13 | 59.9 kB | 265.0 kB | [список файлів] |
| x32 (unofficial port) | 0.1.8-1 | 58.6 kB | 258.0 kB | [список файлів] |