[ Source: lumpy-sv ]
Пакунок: lumpy-sv (0.3.1+dfsg-5)
Links for lumpy-sv
Debian Resources:
Download Source Package lumpy-sv:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
general probabilistic framework for structural variant discovery
LUMPY, a novel SV discovery framework that naturally integrates multiple SV signals jointly across multiple samples. LUMPY yields improved sensitivity, especially when SV signal is reduced owing to either low coverage data or low intra-sample variant allele frequency.
Інші пакунки пов'язані з lumpy-sv
|
|
|
|
-
- dep: bamkit
- tools for common BAM file manipulations
-
- dep: libbamtools2.5.1 (>= 2.5.1+dfsg)
- dynamic library for manipulating BAM (genome alignment) files
-
- dep: libc6 (>= 2.29)
- Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64el]
- Допоміжна бібліотека GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]
-
- dep: libgzstream0 (>= 1.5+dfsg)
- provide functionality of zlib C-library in a C++ iostream
-
- dep: libhts3 (>= 1.10)
- C library for high-throughput sequencing data formats
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armel, armhf]
- Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3
- dep: libstdc++6 (>= 9) [not armel, armhf]
-
- dep: python3
- Інтерактивна обʼєктно-орієнтована мова високого рівня (типова версія „python3“)
-
- dep: python3-numpy
- Швидкі методи для роботи з числовими масивами для мови Python 3
-
- dep: python3-pysam
- interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)
-
- dep: samblaster
- marks duplicates, extracts discordant/split reads
-
- dep: samtools
- processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
-
- rec: sambamba
- tools for working with SAM/BAM data
Завантажити lumpy-sv
| Архітектура | Розмір пакунка | Розмір після встановлення | Файли |
|---|---|---|---|
| amd64 | 181.5 kB | 631.0 kB | [список файлів] |
| arm64 | 159.7 kB | 563.0 kB | [список файлів] |
| armel | 153.3 kB | 545.0 kB | [список файлів] |
| armhf | 161.4 kB | 433.0 kB | [список файлів] |
| i386 | 198.4 kB | 673.0 kB | [список файлів] |
| mips64el | 167.4 kB | 720.0 kB | [список файлів] |
| mipsel | 175.8 kB | 708.0 kB | [список файлів] |
| ppc64el | 183.2 kB | 803.0 kB | [список файлів] |