all options
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Source: concavity  ]

Пакунок: concavity (0.1+dfsg.1-5)

Links for concavity

Screenshot

Debian Resources:

Download Source Package concavity:

Maintainers:

External Resources:

Similar packages:

predictor of protein ligand binding sites from structure and conservation

ConCavity predicts protein ligand binding sites by combining evolutionary sequence conservation and 3D structure.

ConCavity takes as input a PDB format protein structure and optionally files that characterize the evolutionary sequence conservation of the chains in the structure file.

The following result files are produced by default:

 * Residue ligand binding predictions for each chain (*.scores).
 * Residue ligand binding predictions in a PDB format file (residue
   scores placed in the temp. factor field, *_residue.pdb).
 * Pocket prediction locations in a DX format file (*.dx).
 * PyMOL script to visualize the predictions (*.pml).

Інші пакунки пов'язані з concavity

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Завантажити concavity

Завантаження для всіх доступних архітектур
Архітектура Розмір пакунка Розмір після встановлення Файли
amd64 238.5 kB973.0 kB [список файлів]
arm64 224.0 kB941.0 kB [список файлів]
armel 224.9 kB933.0 kB [список файлів]
armhf 222.9 kB809.0 kB [список файлів]
i386 252.5 kB1,020.0 kB [список файлів]
mips64el 252.7 kB1,168.0 kB [список файлів]
mipsel 259.2 kB1,112.0 kB [список файлів]
ppc64el 252.8 kB1,130.0 kB [список файлів]
s390x 224.1 kB969.0 kB [список файлів]