Пакет: concavity (0.1+dfsg.1-5)

Връзки за concavity

Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник concavity.

Отговорници:

Външни препратки:

Начална страница [compbio.cs.princeton.edu]

Подобни пакети:

predictor of protein ligand binding sites from structure and conservation

ConCavity predicts protein ligand binding sites by combining evolutionary sequence conservation and 3D structure.

ConCavity takes as input a PDB format protein structure and optionally files that characterize the evolutionary sequence conservation of the chains in the structure file.

The following result files are produced by default:

 * Residue ligand binding predictions for each chain (*.scores).
 * Residue ligand binding predictions in a PDB format file (residue
   scores placed in the temp. factor field, *_residue.pdb).
 * Pocket prediction locations in a DX format file (*.dx).
 * PyMOL script to visualize the predictions (*.pml).

Други пакети, свързани с concavity

зависимости

препоръчани

предложени

enhances

dep: libc6 (>= 2.29)

GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armel, armhf]

GCC support library

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
dep: libstdc++6 (>= 5)

GNU Standard C++ Library v3

sug: conservation-code

protein sequence conservation scoring tool
sug: pymol

Molecular Graphics System

Изтегляне на concavity

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
amd64	238,5 кБ	973,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	224,0 кБ	941,0 кБ	[списък на файловете]
armel	224,9 кБ	933,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	222,9 кБ	809,0 кБ	[списък на файловете]
i386	252,5 кБ	1 020,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	252,7 кБ	1 168,0 кБ	[списък на файловете]
mipsel	259,2 кБ	1 112,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	252,8 кБ	1 130,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	224,1 кБ	969,0 кБ	[списък на файловете]