all options
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Source: miniasm  ]

Пакунок: miniasm (0.3+dfsg-4)

Links for miniasm

Screenshot

Debian Resources:

Download Source Package miniasm:

Maintainers:

External Resources:

Similar packages:

ultrafast de novo assembler for long noisy DNA sequencing reads

Miniasm is an experimental very fast OLC-based de novo assembler for noisy long reads. It takes all-vs-all read self-mappings (typically by minimap) as input and outputs an assembly graph in the GFA format. Different from mainstream assemblers, miniasm does not have a consensus step. It simply concatenates pieces of read sequences to generate the final unitig sequences. Thus the per-base error rate is similar to the raw input reads.

Tags: Biology: Nucleic Acids, Field: Biology, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c, User Interface: Command Line, Role: role::program, science::calculation, Purpose: Calculating, use::comparing, works-with::biological-sequence

Інші пакунки пов'язані з miniasm

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Завантажити miniasm

Завантаження для всіх доступних архітектур
Архітектура Розмір пакунка Розмір після встановлення Файли
amd64 29.2 kB71.0 kB [список файлів]
arm64 26.4 kB82.0 kB [список файлів]
armel 27.7 kB82.0 kB [список файлів]
armhf 26.3 kB82.0 kB [список файлів]
i386 31.2 kB78.0 kB [список файлів]
mips64el 29.7 kB86.0 kB [список файлів]
mipsel 29.5 kB85.0 kB [список файлів]
ppc64el 31.9 kB83.0 kB [список файлів]
s390x 28.4 kB70.0 kB [список файлів]