Paket: cufflinks (2.2.1+dfsg.1-9 ve diğerleri) [non-free]

cufflinks için bağlantılar

Debian Kaynakları:

cufflinks Kaynak Paketini İndir:

Geliştiriciler:

Dış Kaynaklar:

Ana Sayfa [cufflinks.cbcb.umd.edu]

Benzer paketler:

Transcript assembly, differential expression and regulation for RNA-Seq

Cufflinks assembles transcripts, estimates their abundances, and tests for differential expression and regulation in RNA-Seq samples. It accepts aligned RNA-Seq reads and assembles the alignments into a parsimonious set of transcripts. Cufflinks then estimates the relative abundances of these transcripts based on how many reads support each one.

This package provides the binary of cufflinks and associated tools, i.e. compress_gtf, cuffcompare, cuffdiff, cuffmerge, cuffnorm, cuffquant and gtf_to_sam.

Etiketler: Biyoloji: Nükleik Asitler, Alan: Biyoloji, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c++, Rol: Program, Şununla çalışır: Biyolojik Dizi

cufflinks ile İlgili Diğer Paketler

bağımlılıklar

tavsiye edilen

önerilen

enhances

dep: libboost-serialization1.83.0 (>= 1.83.0)

serialization library for C++
dep: libboost-thread1.83.0 (>= 1.83.0)

portable C++ multi-threading
dep: libc6 (>= 2.34)

GNU C Library: Shared libraries
ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 4.0) [amd64, armel, armhf]

GCC support library

dep: libgcc-s1 (>= 4.1) [s390x]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ppc64el]

dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el, riscv64]

dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]
dep: libstdc++6 (>= 13.1)

GNU Standard C++ Library v3
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

compression library - runtime

rec: gffread

GFF/GTF format conversions, region filtering, FASTA sequence extraction

enh: tophat

Paket mevcut değil

cufflinks indir

Tüm mevcut mimariler için indir
Mimari	Sürüm	Paket Boyutu	Kurulu Boyut	Dosyalar
amd64	2.2.1+dfsg.1-9+b1	1.515,8 kB	10.573,0 kB	[dosya listesi]
arm64	2.2.1+dfsg.1-9+b1	1.406,4 kB	10.471,0 kB	[dosya listesi]
armel	2.2.1+dfsg.1-9+b1	1.246,6 kB	9.506,0 kB	[dosya listesi]
armhf	2.2.1+dfsg.1-9+b1	1.138,5 kB	6.422,0 kB	[dosya listesi]
i386	2.2.1+dfsg.1-9+b1	1.538,5 kB	10.692,0 kB	[dosya listesi]
mips64el	2.2.1+dfsg.1-9+b1	1.559,0 kB	15.287,0 kB	[dosya listesi]
ppc64el	2.2.1+dfsg.1-9+b1	1.519,6 kB	13.479,0 kB	[dosya listesi]
riscv64	2.2.1+dfsg.1-9+b1	1.512,8 kB	8.543,0 kB	[dosya listesi]
s390x	2.2.1+dfsg.1-9+b1	1.464,1 kB	11.663,0 kB	[dosya listesi]