tüm seçenekler
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Kaynak: python-pyfaidx  ]

Paket: python-pyfaidx-examples (0.5.5.2-1)

python-pyfaidx-examples için bağlantılar

Screenshot

Debian Kaynakları:

python-pyfaidx Kaynak Paketini İndir:

Geliştiriciler:

Dış Kaynaklar:

Benzer paketler:

example data for efficient random access to fasta subsequences for Python

Samtools provides a function "faidx" (FAsta InDeX), which creates a small flat index file ".fai" allowing for fast random access to any subsequence in the indexed FASTA file, while loading a minimal amount of the file in to memory. This Python module implements pure Python classes for indexing, retrieval, and in-place modification of FASTA files using a samtools compatible index. The pyfaidx module is API compatible with the pygr seqdb module. A command-line script "faidx" is installed alongside the pyfaidx module, and facilitates complex manipulation of FASTA files without any programming knowledge.

This package provides example data to test the Python modules.

python-pyfaidx-examples ile İlgili Diğer Paketler

  • bağımlılıklar
  • tavsiye edilen
  • önerilen
  • enhances

python-pyfaidx-examples indir

Tüm mevcut mimariler için indir
Mimari Paket Boyutu Kurulu Boyut Dosyalar
all 46,1 kB66,0 kB [dosya listesi]