[ Källkod: sprai ]
Paket: sprai (0.9.9.23+dfsg1-3 och andra)
Länkar för sprai
Debianresurser:
Hämta källkodspaketet sprai:
- [sprai_0.9.9.23+dfsg1-3.dsc]
- [sprai_0.9.9.23+dfsg1.orig.tar.xz]
- [sprai_0.9.9.23+dfsg1-3.debian.tar.xz]
Ansvariga:
Externa resurser:
- Hemsida [web.archive.org]
Liknande paket:
single-pass sequencing read accuracy improver
Sprai is a tool to correct sequencing errors in single-pass reads for de novo assembly. It is originally designed for correcting sequencing errors in single-molecule DNA sequencing reads, especially in Continuous Long Reads (CLRs) generated by PacBio RS sequencers. The goal of Sprai is not maximizing the accuracy of error-corrected reads. Instead, Sprai aims at maximizing the continuity (i.e., N50 contig length) of assembled contigs after error correction.
Andra paket besläktade med sprai
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34) [ej alpha, ia64, sh4]
- GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.39) [sh4]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.30) [ia64]
- GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
-
- dep: ncbi-blast+
- next generation suite of BLAST sequence search tools
-
- dep: perl
- Larry Wall's Practical Extraction and Report Language
-
- dep: time
- GNU time program for measuring CPU resource usage
-
- sug: make
- utility for directing compilation
-
- sug: pbalign
- Paketet inte tillgängligt
-
- sug: pbgenomicconsensus
- Paketet inte tillgängligt
-
- sug: pbh5tools
- Paketet inte tillgängligt
Hämta sprai
| Arkitektur | Version | Paketstorlek | Installerad storlek | Filer |
|---|---|---|---|---|
| alpha (inofficiell anpassning) | 0.9.9.23+dfsg1-3 | 1.476,5 kbyte | 1.881,0 kbyte | [filförteckning] |
| amd64 | 0.9.9.23+dfsg1-3 | 1.477,2 kbyte | 1.713,0 kbyte | [filförteckning] |
| arm64 | 0.9.9.23+dfsg1-3 | 1.473,8 kbyte | 1.881,0 kbyte | [filförteckning] |
| armel | 0.9.9.23+dfsg1-3 | 1.473,0 kbyte | 1.693,0 kbyte | [filförteckning] |
| armhf | 0.9.9.23+dfsg1-3 | 1.471,6 kbyte | 1.669,0 kbyte | [filförteckning] |
| hppa (inofficiell anpassning) | 0.9.9.23+dfsg1-3 | 1.475,5 kbyte | 1.692,0 kbyte | [filförteckning] |
| i386 | 0.9.9.23+dfsg1-3 | 1.477,6 kbyte | 1.713,0 kbyte | [filförteckning] |
| ia64 (inofficiell anpassning) | 0.9.9.23+dfsg1-2 | 1.485,0 kbyte | 1.738,0 kbyte | [filförteckning] |
| m68k (inofficiell anpassning) | 0.9.9.23+dfsg1-3 | 1.474,6 kbyte | 1.693,0 kbyte | [filförteckning] |
| mips64el | 0.9.9.23+dfsg1-3 | 1.477,2 kbyte | 1.885,0 kbyte | [filförteckning] |
| ppc64 (inofficiell anpassning) | 0.9.9.23+dfsg1-3 | 1.477,7 kbyte | 1.881,0 kbyte | [filförteckning] |
| ppc64el | 0.9.9.23+dfsg1-3 | 1.478,1 kbyte | 1.881,0 kbyte | [filförteckning] |
| riscv64 | 0.9.9.23+dfsg1-3 | 1.474,3 kbyte | 1.689,0 kbyte | [filförteckning] |
| s390x | 0.9.9.23+dfsg1-3 | 1.476,0 kbyte | 1.701,0 kbyte | [filförteckning] |
| sh4 (inofficiell anpassning) | 0.9.9.23+dfsg1-3 | 1.477,7 kbyte | 1.877,0 kbyte | [filförteckning] |
| sparc64 (inofficiell anpassning) | 0.9.9.23+dfsg1-3 | 1.474,5 kbyte | 5.722,0 kbyte | [filförteckning] |
| x32 (inofficiell anpassning) | 0.9.9.23+dfsg1-3 | 1.476,4 kbyte | 1.705,0 kbyte | [filförteckning] |