Paket: tree-ppuzzle (5.3~rc16+dfsg-9 och andra)

Länkar för tree-ppuzzle

Debianresurser:

Hämta källkodspaketet tree-puzzle:

Ansvariga:

Debian Med Packaging Team (QA-sida, E-postarkiv)
Andreas Tille (QA-sida)
Charles Plessy (QA-sida)

Externa resurser:

Hemsida [www.tree-puzzle.de]

Liknande paket:

Parallelized reconstruction of phylogenetic trees by maximum likelihood

TREE-PUZZLE (the new name for PUZZLE) is an interactive console program that implements a fast tree search algorithm, quartet puzzling, that allows analysis of large data sets and automatically assigns estimations of support to each internal branch. TREE-PUZZLE also computes pairwise maximum likelihood distances as well as branch lengths for user specified trees. Branch lengths can also be calculated under the clock-assumption. In addition, TREE-PUZZLE offers a novel method, likelihood mapping, to investigate the support of a hypothesized internal branch without computing an overall tree and to visualize the phylogenetic content of a sequence alignment.

This is the parallelized version of tree-puzzle.

Märken: Field: Biologi, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::analysing, use::comparing, Supports Format: Plain Text, Works with: Behöver ett märke till

Andra paket besläktade med tree-ppuzzle

beror

rekommenderar

föreslår

enhances

dep: libc6 (>= 2.34) [ej alpha, ia64, sh4]

GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libopenmpi3t64 (>= 4.1.6)

high performance message passing library -- shared library
dep: libsprng2

SPRNG Scalable Parallel RNG library -- library package
dep: openmpi-bin

high performance message passing library -- binaries

rec: tree-puzzle-doc

Reconstruction of phylogenetic trees by maximum likelihood (doc)

sug: phylip

package of programs for inferring phylogenies
sug: treetool

Paketet inte tillgängligt

Hämta tree-ppuzzle

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer
Arkitektur	Version	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
alpha (inofficiell anpassning)	5.3~rc16+dfsg-9+b1	181,6 kbyte	557,0 kbyte	[filförteckning]
amd64	5.3~rc16+dfsg-9+b1	181,5 kbyte	433,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	5.3~rc16+dfsg-9+b1	164,6 kbyte	428,0 kbyte	[filförteckning]
armel	5.3~rc16+dfsg-9+b1	174,2 kbyte	448,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	5.3~rc16+dfsg-9+b1	165,2 kbyte	332,0 kbyte	[filförteckning]
hppa (inofficiell anpassning)	5.3~rc16+dfsg-9+b1	172,1 kbyte	437,0 kbyte	[filförteckning]
i386	5.3~rc16+dfsg-9+b1	193,8 kbyte	532,0 kbyte	[filförteckning]
ia64 (inofficiell anpassning)	5.3~rc16+dfsg-9+b1	233,7 kbyte	860,0 kbyte	[filförteckning]
m68k (inofficiell anpassning)	5.3~rc16+dfsg-9+b1	165,7 kbyte	452,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	5.3~rc16+dfsg-9+b1	180,0 kbyte	511,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64 (inofficiell anpassning)	5.3~rc16+dfsg-9+b1	193,5 kbyte	557,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	5.3~rc16+dfsg-9+b1	191,6 kbyte	557,0 kbyte	[filförteckning]
riscv64	5.3~rc16+dfsg-9+b2	182,2 kbyte	377,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	5.3~rc16+dfsg-9+b1	193,7 kbyte	484,0 kbyte	[filförteckning]
sh4 (inofficiell anpassning)	5.3~rc16+dfsg-9+b1	196,8 kbyte	429,0 kbyte	[filförteckning]
sparc64 (inofficiell anpassning)	5.3~rc16+dfsg-9+b1	166,6 kbyte	1.071,0 kbyte	[filförteckning]
x32 (inofficiell anpassning)	5.3~rc16+dfsg-9+b1	177,3 kbyte	416,0 kbyte	[filförteckning]