Balík: tree-ppuzzle (5.3~rc16+dfsg-10 a iné)

Odkazy pre tree-ppuzzle

Zdroje Debian:

Stiahnuť zdrojový balík tree-puzzle:

Správcovia:

Externé zdroje:

Domovská stránka [www.tree-puzzle.de]

Podobné balíky:

Parallelized reconstruction of phylogenetic trees by maximum likelihood

TREE-PUZZLE (the new name for PUZZLE) is an interactive console program that implements a fast tree search algorithm, quartet puzzling, that allows analysis of large data sets and automatically assigns estimations of support to each internal branch. TREE-PUZZLE also computes pairwise maximum likelihood distances as well as branch lengths for user specified trees. Branch lengths can also be calculated under the clock-assumption. In addition, TREE-PUZZLE offers a novel method, likelihood mapping, to investigate the support of a hypothesized internal branch without computing an overall tree and to visualize the phylogenetic content of a sequence alignment.

This is the parallelized version of tree-puzzle.

Značky: Pole: Biológia, Bioinformatika, Implementované v: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::analysing, use::comparing, Supports Format: Plain Text, Works with: Need an extra tag

Ostatné balíky súvisiace s balíkom tree-ppuzzle

závisí

odporúča

navrhuje

vylepšuje

dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, ia64, sh4]

knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.39) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libopenmpi3t64 (>= 4.1.6)

knižnica na vyskokovýkonné odovzdávanie správ - zdieľaná knižnica
dep: libsprng2

SPRNG Scalable Parallel RNG library -- library package
dep: openmpi-bin

knižnica na vyskokovýkonné odovzdávanie správ - spustiteľné súbory

rec: tree-puzzle-doc

Reconstruction of phylogenetic trees by maximum likelihood (doc)

sug: phylip

package of programs for inferring phylogenies
sug: treetool

Balík nie je dostupný

Stiahnuť tree-ppuzzle

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
alpha (neoficiálny port)	5.3~rc16+dfsg-10	182.3 kB	556.0 kB	[zoznam súborov]
amd64	5.3~rc16+dfsg-10	182.8 kB	440.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	5.3~rc16+dfsg-10	167.0 kB	428.0 kB	[zoznam súborov]
armel	5.3~rc16+dfsg-10	176.3 kB	451.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	5.3~rc16+dfsg-10	167.1 kB	331.0 kB	[zoznam súborov]
hppa (neoficiálny port)	5.3~rc16+dfsg-10	173.1 kB	440.0 kB	[zoznam súborov]
i386	5.3~rc16+dfsg-10	196.2 kB	543.0 kB	[zoznam súborov]
ia64 (neoficiálny port)	5.3~rc16+dfsg-9+b1	233.7 kB	860.0 kB	[zoznam súborov]
m68k (neoficiálny port)	5.3~rc16+dfsg-10	165.0 kB	451.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	5.3~rc16+dfsg-10	181.3 kB	574.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64 (neoficiálny port)	5.3~rc16+dfsg-10	195.6 kB	556.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	5.3~rc16+dfsg-10	193.1 kB	556.0 kB	[zoznam súborov]
riscv64	5.3~rc16+dfsg-10	186.2 kB	384.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	5.3~rc16+dfsg-10	196.2 kB	491.0 kB	[zoznam súborov]
sh4 (neoficiálny port)	5.3~rc16+dfsg-10	198.3 kB	428.0 kB	[zoznam súborov]
sparc64 (neoficiálny port)	5.3~rc16+dfsg-10	167.6 kB	1,070.0 kB	[zoznam súborov]
x32 (neoficiálny port)	5.3~rc16+dfsg-10	179.3 kB	423.0 kB	[zoznam súborov]