[ Källkod: ska ]
Paket: ska (1.0+dfsg-4)
Länkar för ska
Debianresurser:
Hämta källkodspaketet ska:
Ansvariga:
Externa resurser:
- Hemsida [github.com]
Liknande paket:
Split Kmer Analysis
SKA (Split Kmer Analysis) is a toolkit for prokaryotic (and any other small, haploid) DNA sequence analysis using split kmers. A split kmer is a pair of kmers in a DNA sequence that are separated by a single base. Split kmers allow rapid comparison and alignment of small genomes, and is particulalry suited for surveillance or outbreak investigation. SKA can produce split kmer files from fasta format assemblies or directly from fastq format read sequences, cluster them, align them with or without a reference sequence and provide various comparison and summary statistics. Currently all testing has been carried out on high-quality Illumina read data, so results for other platforms may vary.
Andra paket besläktade med ska
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34) [ej alpha, ia64, sh4]
- GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [arm64, ppc64el, s390x]
- GCC stödbibliotek
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, amd64, mips64el, ppc64, riscv64, sh4, sparc64, x32]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64]
-
- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]
- GCC stödbibliotek
-
- dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]
- GCC stödbibliotek
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- GNU standardbibliotek v3 för C++
-
- dep: libunwind8 [ia64]
- library to determine the call-chain of a program - runtime
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- Kompressionsbibliotek - körtidspaket
Hämta ska
| Arkitektur | Paketstorlek | Installerad storlek | Filer |
|---|---|---|---|
| alpha (inofficiell anpassning) | 133,7 kbyte | 543,0 kbyte | [filförteckning] |
| amd64 | 143,9 kbyte | 451,0 kbyte | [filförteckning] |
| arm64 | 121,9 kbyte | 415,0 kbyte | [filförteckning] |
| armel | 119,9 kbyte | 394,0 kbyte | [filförteckning] |
| armhf | 124,9 kbyte | 314,0 kbyte | [filförteckning] |
| hppa (inofficiell anpassning) | 138,9 kbyte | 436,0 kbyte | [filförteckning] |
| i386 | 149,6 kbyte | 482,0 kbyte | [filförteckning] |
| ia64 (inofficiell anpassning) | 175,0 kbyte | 846,0 kbyte | [filförteckning] |
| m68k (inofficiell anpassning) | 117,8 kbyte | 422,0 kbyte | [filförteckning] |
| mips64el | 125,3 kbyte | 514,0 kbyte | [filförteckning] |
| ppc64 (inofficiell anpassning) | 138,2 kbyte | 545,0 kbyte | [filförteckning] |
| ppc64el | 138,4 kbyte | 543,0 kbyte | [filförteckning] |
| riscv64 | 140,4 kbyte | 363,0 kbyte | [filförteckning] |
| s390x | 142,4 kbyte | 463,0 kbyte | [filförteckning] |
| sh4 (inofficiell anpassning) | 148,8 kbyte | 414,0 kbyte | [filförteckning] |
| sparc64 (inofficiell anpassning) | 118,6 kbyte | 1.122,0 kbyte | [filförteckning] |
| x32 (inofficiell anpassning) | 138,5 kbyte | 426,0 kbyte | [filförteckning] |