[ Källkod: minimap2 ]
Paket: python3-mappy (2.27+dfsg-1 och andra)
Länkar för python3-mappy
Debianresurser:
Hämta källkodspaketet minimap2:
Ansvariga:
Externa resurser:
- Hemsida [github.com]
Liknande paket:
Python3 interface minimap2
Minimap2 is a versatile sequence alignment program that aligns DNA or mRNA sequences against a large reference database. Typical use cases include: (1) mapping PacBio or Oxford Nanopore genomic reads to the human genome; (2) finding overlaps between long reads with error rate up to ~15%; (3) splice-aware alignment of PacBio Iso-Seq or Nanopore cDNA or Direct RNA reads against a reference genome; (4) aligning Illumina single- or paired-end reads; (5) assembly-to-assembly alignment; (6) full- genome alignment between two closely related species with divergence below ~15%.
This package contains the Python3 interface for using minimap2.
Andra paket besläktade med python3-mappy
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.29) [x32]
- GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.34) [ej alpha, ia64, sh4, x32]
- dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
- dep: python3 (<< 3.11) [x32]
- dep: python3 (<< 3.13) [ej x32]
- dep: python3 (>= 3.10~) [x32]
- dep: python3 (>= 3.11~) [ej x32]
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)
- Kompressionsbibliotek - körtidspaket
Hämta python3-mappy
| Arkitektur | Version | Paketstorlek | Installerad storlek | Filer |
|---|---|---|---|---|
| alpha (inofficiell anpassning) | 2.26+dfsg-1 | 210,2 kbyte | 956,0 kbyte | [filförteckning] |
| amd64 | 2.27+dfsg-1 | 175,9 kbyte | 671,0 kbyte | [filförteckning] |
| arm64 | 2.27+dfsg-1 | 167,3 kbyte | 695,0 kbyte | [filförteckning] |
| armel | 2.27+dfsg-1 | 188,7 kbyte | 777,0 kbyte | [filförteckning] |
| armhf | 2.27+dfsg-1 | 190,7 kbyte | 561,0 kbyte | [filförteckning] |
| hppa (inofficiell anpassning) | 2.27+dfsg-1 | 226,9 kbyte | 907,0 kbyte | [filförteckning] |
| i386 | 2.27+dfsg-1 | 225,1 kbyte | 985,0 kbyte | [filförteckning] |
| ia64 (inofficiell anpassning) | 2.24+dfsg-3+b1 | 256,8 kbyte | 1.500,0 kbyte | [filförteckning] |
| m68k (inofficiell anpassning) | 2.27+dfsg-1 | 187,0 kbyte | 799,0 kbyte | [filförteckning] |
| mips64el | 2.27+dfsg-1 | 195,8 kbyte | 977,0 kbyte | [filförteckning] |
| ppc64 (inofficiell anpassning) | 2.27+dfsg-1 | 215,4 kbyte | 1.079,0 kbyte | [filförteckning] |
| ppc64el | 2.27+dfsg-1 | 200,1 kbyte | 951,0 kbyte | [filförteckning] |
| riscv64 | 2.27+dfsg-1 | 222,9 kbyte | 679,0 kbyte | [filförteckning] |
| s390x | 2.27+dfsg-1 | 227,8 kbyte | 955,0 kbyte | [filförteckning] |
| sh4 (inofficiell anpassning) | 2.24+dfsg-3+b2 | 233,3 kbyte | 693,0 kbyte | [filförteckning] |
| sparc64 (inofficiell anpassning) | 2.27+dfsg-1 | 183,0 kbyte | 2.115,0 kbyte | [filförteckning] |
| x32 (inofficiell anpassning) | 2.24+dfsg-2+b1 | 143,0 kbyte | 341,0 kbyte | [filförteckning] |