[ Källkod: minia ]
Paket: minia (3.2.1+git20200522.4960a99-1)
Länkar för minia
Debianresurser:
Hämta källkodspaketet minia:
- [minia_3.2.1+git20200522.4960a99-1.dsc]
- [minia_3.2.1+git20200522.4960a99.orig.tar.xz]
- [minia_3.2.1+git20200522.4960a99-1.debian.tar.xz]
Ansvariga:
Externa resurser:
- Hemsida [minia.genouest.org]
Liknande paket:
short-read biological sequence assembler
Short-read DNA sequence assembler based on a de Bruijn graph, capable of assembling a human genome on a desktop computer in a day.
The output of Minia is a set of contigs. Minia produces results of similar contiguity and accuracy to other de Bruijn assemblers (e.g. Velvet).
Andra paket besläktade med minia
|
|
|
|
-
- dep: bc
- GNU bc arbitrary precision calculator language
-
- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]
- dep: libc6 (>= 2.4) [i386, mips64el, s390x]
-
- dep: libgatbcore3 (>= 1.4.1+git20191130.664696c+dfsg) [amd64]
- dynamic library of the Genome Analysis Toolbox
- dep: libgatbcore3 (>= 1.4.2+dfsg) [ej amd64]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ej i386]
- GCC stödbibliotek
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386]
-
- dep: libhdf5-103-1
- HDF5 C runtime files - serial version
-
- dep: libstdc++6 (>= 9)
- GNU standardbibliotek v3 för C++
-
- dep: zlib1g
- Kompressionsbibliotek - körtidspaket
-
- rec: samtools
- processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
-
- sug: bandage
- Bioinformatics Application for Navigating De novo Assembly Graphs Easily
Hämta minia
| Arkitektur | Paketstorlek | Installerad storlek | Filer |
|---|---|---|---|
| amd64 | 388,9 kbyte | 740,0 kbyte | [filförteckning] |
| arm64 | 381,8 kbyte | 728,0 kbyte | [filförteckning] |
| i386 | 397,0 kbyte | 742,0 kbyte | [filförteckning] |
| mips64el | 379,7 kbyte | 779,0 kbyte | [filförteckning] |
| ppc64el | 389,6 kbyte | 824,0 kbyte | [filförteckning] |
| s390x | 381,8 kbyte | 752,0 kbyte | [filförteckning] |