Paquet : minia (3.2.1+git20200522.4960a99-1)

Liens pour minia

Short-read DNA sequence assembler based on a de Bruijn graph, capable of assembling a human genome on a desktop computer in a day.

The output of Minia is a set of contigs. Minia produces results of similar contiguity and accuracy to other de Bruijn assemblers (e.g. Velvet).

dep: bc

langage de calculateur de précision arbitraire bc GNU
dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.4) [i386, mips64el, s390x]
dep: libgatbcore3 (>= 1.4.1+git20191130.664696c+dfsg) [amd64]

dynamic library of the Genome Analysis Toolbox

dep: libgatbcore3 (>= 1.4.2+dfsg) [non amd64]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [non i386]

bibliothèque de prise en charge de GCC

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386]
dep: libhdf5-103-1

HDF5 C runtime files - serial version
dep: libstdc++6 (>= 9)

bibliothèque standard C++ de GNU v3
dep: zlib1g

Bibliothèque de compression - binaires

rec: samtools

traitement d'alignements de séquence pour les formats SAM et BAM et CRAM

sug: bandage

application de bio-informatique pour navigation simple dans les graphes d’assemblage De novo

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	388,9 ko	740,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	381,8 ko	728,0 ko	[liste des fichiers]
i386	397,0 ko	742,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	379,7 ko	779,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	389,6 ko	824,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	381,8 ko	752,0 ko	[liste des fichiers]