[ Källkod: anfo ]
Paket: anfo (0.98-8)
Länkar för anfo
Debianresurser:
Hämta källkodspaketet anfo:
Ansvariga:
Externa resurser:
- Hemsida [bioinf.eva.mpg.de]
Liknande paket:
Short Read Aligner/Mapper from MPG
Anfo is a mapper in the spirit of Soap/Maq/Bowtie, but its implementation takes more after BLAST/BLAT. It's most useful for the alignment of sequencing reads where the DNA sequence is somehow modified (think ancient DNA or bisulphite treatment) and/or there is more divergence between sample and reference than what fast mappers will handle gracefully (say the reference genome is missing and a related species is used instead).
Andra paket besläktade med anfo
|
|
|
|
-
- dep: libanfo0 (>= 0.98)
- Library for Short Read Aligner/Mapper from MPG
-
- dep: libc6 (>= 2.29)
- GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb
-
- dep: libelk0
- implementation of Scheme (the Extension Language Kit)
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ej armel, armhf, i386, mipsel]
- GCC stödbibliotek
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]
-
- dep: libpopt0 (>= 1.14)
- Bibliotek för att analysera kommandoparametrar
-
- dep: libprotobuf23 (>= 3.12.3)
- protocol buffers C++ library
-
- dep: libstdc++6 (>= 9)
- GNU standardbibliotek v3 för C++
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- Kompressionsbibliotek - körtidspaket
Hämta anfo
| Arkitektur | Paketstorlek | Installerad storlek | Filer |
|---|---|---|---|
| amd64 | 113,9 kbyte | 439,0 kbyte | [filförteckning] |
| arm64 | 105,2 kbyte | 395,0 kbyte | [filförteckning] |
| armel | 99,8 kbyte | 345,0 kbyte | [filförteckning] |
| armhf | 102,0 kbyte | 305,0 kbyte | [filförteckning] |
| i386 | 119,6 kbyte | 417,0 kbyte | [filförteckning] |
| mips64el | 109,5 kbyte | 438,0 kbyte | [filförteckning] |
| mipsel | 110,5 kbyte | 411,0 kbyte | [filförteckning] |
| ppc64el | 114,8 kbyte | 619,0 kbyte | [filförteckning] |
| s390x | 104,0 kbyte | 411,0 kbyte | [filförteckning] |