Paketti: anfo (0.98-8)
Links for anfo
Debian-palvelut:
Imuroi lähdekoodipaketti anfo:
Ylläpitäjät:
- Debian Med Packaging Team (Laadunvalvontasivu, Mail Archive)
- Tim Booth (Laadunvalvontasivu)
- Andreas Tille (Laadunvalvontasivu)
External Resources:
- Kotisivu [bioinf.eva.mpg.de]
Samankaltaisia paketteja:
Short Read Aligner/Mapper from MPG
Anfo is a mapper in the spirit of Soap/Maq/Bowtie, but its implementation takes more after BLAST/BLAT. It's most useful for the alignment of sequencing reads where the DNA sequence is somehow modified (think ancient DNA or bisulphite treatment) and/or there is more divergence between sample and reference than what fast mappers will handle gracefully (say the reference genome is missing and a related species is used instead).
Muut pakettiin anfo liittyvät paketit
|
|
|
|
-
- dep: libanfo0 (>= 0.98)
- Library for Short Read Aligner/Mapper from MPG
-
- dep: libc6 (>= 2.29)
- GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
-
- dep: libelk0
- implementation of Scheme (the Extension Language Kit)
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ei armel, armhf, i386, mipsel]
- GCC:n apukirjasto
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]
-
- dep: libpopt0 (>= 1.14)
- kirjasto komentoriviparametrien jäsentämiseen
-
- dep: libprotobuf23 (>= 3.12.3)
- protocol buffers C++ library
-
- dep: libstdc++6 (>= 9)
- GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot
Imuroi anfo
Arkkitehtuuri | Paketin koko | Koko asennettuna | Tiedostot |
---|---|---|---|
amd64 | 113.9 kt | 439.0 kt | [tiedostoluettelo] |
arm64 | 105.2 kt | 395.0 kt | [tiedostoluettelo] |
armel | 99.8 kt | 345.0 kt | [tiedostoluettelo] |
armhf | 102.0 kt | 305.0 kt | [tiedostoluettelo] |
i386 | 119.6 kt | 417.0 kt | [tiedostoluettelo] |
mips64el | 109.5 kt | 438.0 kt | [tiedostoluettelo] |
mipsel | 110.5 kt | 411.0 kt | [tiedostoluettelo] |
ppc64el | 114.8 kt | 619.0 kt | [tiedostoluettelo] |
s390x | 104.0 kt | 411.0 kt | [tiedostoluettelo] |