Paket: sniffles (1.0.12b+ds-1)

Länkar för sniffles

Debianresurser:

Hämta källkodspaketet sniffles:

Ansvariga:

Externa resurser:

Hemsida [fritzsedlazeck.github.io]

Liknande paket:

structural variation caller using third-generation sequencing

Sniffles is a structural variation (SV) caller using third-generation sequencing data such as those from Pacific Biosciences or Oxford Nanopore platforms. It detects all types of SVs using evidence from split-read alignments, high-mismatch regions, and coverage analysis.

Andra paket besläktade med sniffles

beror

rekommenderar

föreslår

enhances

dep: libbamtools2.5.1 (>= 2.5.1+dfsg)

dynamic library for manipulating BAM (genome alignment) files
dep: libc6 (>= 2.29)

GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

GCC stödbibliotek
dep: libgomp1 (>= 4.9)

GCC OpenMP (GOMP) support library
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

GNU standardbibliotek v3 för C++

sug: bwa

Burrows-Wheeler Aligner

Hämta sniffles

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer
Arkitektur	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
amd64	703,3 kbyte	1.100,0 kbyte	[filförteckning]